TD Биохимия n; 4, електрофор; se, Exp 1

Експеримент 1: Изграждане на геномна ДНК банка за Candida albicans.

Цел на експеримента:

За да създадете библиотека за мутация на вмъкване (на маркер), първо трябва да изградите геномна ДНК библиотека. Библиотеката за вмъкване ще се използва за намиране на гени, участващи в образуването на биофилм при Candida albicans. Тази опортюнистична гъба често се среща при имуносупресирани пациенти (напр. СПИН), където нахлува в лигавиците и причинява кандидоза (снимка). Въпреки това, колонизацията на повърхности (и образуването на биофилм), като тази на съдовите катетри, също е важен проблем в медицината (вътреболнични инфекции), тъй като може да причини „разпространена“ кандидоза (която може да причини сериозни лезии до потенциално всички вътрешни органи).

Предговор: Инструкции:

Нуждаете се от ревизии? Тук е: Въведение
Имате 25 минути, за да извършите експеримента. Не губете твърде много време.
Прочетете внимателно описанието на преживяването. Когато бъдете помолени да направите избор, помислете за това и кликнете върху отговора, който е най-смислен за вас.
Дори ако сте отговорили правилно, не забравяйте да прочетете другите възможности за избор.
Отговорите на въпросите в курсив обикновено се появяват на друга html страница (щракнете върху въпроса). Не се спирайте на тези въпроси.
Въпросите в червено ще бъдат обсъдени по време на синтеза на опита.
Ако не завършите експеримента в рамките на определеното време, можете да го направите отново по-късно. Уеб адресът на преживяването е свързан на Dokeos.
Винаги можете да ми изпратите вашите коментари по имейл: [email protected].

Това виртуално изживяване е вдъхновено от реални преживявания, но за да се направи урокът по-интересен и да се насърчат въпроси, са направени адаптации (някои от които са малко вероятни).

Въведение:

Конвенция: 1Mb = 1'000 kb = 1'000'000 bp. Това е начин за количествено определяне на размера на молекулите на ДНК в сдвоени нуклеотиди. Всяка аминокиселина (аа) е кодирана (върху ДНК/РНК) от група от 3 нуклеотида (= кодон). Измерване на ORF (= отворена рамка за четене; част от гена, кодиращ протеина)

Следователно 1kb кодира за протеин от

Candida albicans е диплоидна, едноклетъчна (долна еукариотна) гъба, растяща като единична клетка и хифи (нишки на свързани клетки). Биофилмът, образуван от C. albicans, се състои от едноклетъчни, псевдохифални или дори хифални клетки и извънклетъчен матрикс, съставен от полизахариди и протеини. Този биофилм предпазва C. albicans по-специално срещу противогъбични средства. Формирането на биофилм се осъществява на три етапа: първоклетъчни колонии; тогава клетките приемат псевдохифална конформация и произвеждат извънклетъчен матрикс. И накрая, матрицата и нишките (хифа) растат заедно.