Епигенетична комуникация и хронична болка

Според първите публикации на Международния човешки епигеномен консорциум, теорията на мрежата и практическите примери за това как работи Интернет помагат да се разбере как работи епигенетичната комуникационна мрежа.

Консорциумът на Blueprint, финансиран от Европейския съюз, и Международният консорциум за човешка епигеномия имат за цел да изследват епигенома - изследователите наскоро започнаха да публикуват първите си резултати. Изследователи от Института за молекулярна генетика Макс Планк в Берлин и работната група по структурна изчислителна биология към Испанския национален институт за изследване на рака допринесоха за изследването, публикувано в Cell Reports.

Тъй като последният автор на изследването - Epigenomic Co-localization and Co-evolution Reveal the Key Role for 5hmC as the Communication Hub in the Chromatin Network of ESCs - казва, в тяхната работа Теорията на мрежата е използвана за създаване и изследване на първата карта на епигенетичната комуникационна мрежа.

Чрез епигенетични признаци се решава, че коя част от генома е включена или изключена, т.е. кои гени са видими за клетката, напр. също е това по време на което ембрионално развитие, кои стволови клетки образуват клетките на кой орган (например клетки на щитовидната жлеза или черния дроб).

За да нарисуват епигенетичната комуникационна мрежа, Alfonso Valencia et al.Използва 3 вида цитозинови бази.

комуникация
химическа модификация, 13 вида хистонови модификации и 61 вида ДНК-свързващи протеини (използвани са миши ембрионални стволови клетки) и данни за тяхната поява са събрани от литературата. От данни за локализация на целия геном и информация за генната регулация и клетъчната идентичност мрежата на епигенетичната комуникация е създадена с помощта на математически алгоритми, които измерват популярността и въздействието на уебсайтовете (напр. Уикипедия или Facebook). Начертаната мрежа почива на комуникационен модел, в който модификациите на хистон и цитозин се определят като епигенетични сигнали, а свързаните с хроматин протеини действат като излъчватели/излъчватели или приемници на тези сигнали.