Ексклузивно интервю за проекта Pmeasyr БЛОГЪТ на всички PMSI
Бихме искали да отбележим проекта pmeasyr, пакет в R, езикът, посветен на статистиката, добре известен за DIM, който позволява анализите на PMSI да се извършват независимо, включително на големи бази данни на PMSI от няколко 100 000 реда. Това е проект с отворен код, роден в AP-HP, който управлява всички области на PMSI (MCO, SSR, PSY, HAD и ACE). Открийте pmeasyr във видео
Някои възможни резултати с pmeasyr:
# MCO остава с код или семейство диагностични кодове, независимо от позициите им DP, DR или DAS (напр .: остава с код за епилепсия)
# MCO остава с акта EBLA003 "Поставяне на катетър, свързан с дълбока вена", независимо от RUM, в който актът е кодиран
# активна опашка от пациенти с код за затлъстяване в E66 в обекта и/или според кодиращата позиция на кода за затлъстяване
# активно досие на хирургията, разграничаване на CCAM дейности
# DMS при престой по-дълъг от 0 дни
# DMS от GHM/GHS
За да научим повече, интервюирахме Гийом ПРЕСИАТ, по инициатива на този проект, който беше любезен да отговори на нашите въпроси.
Здравейте г-н ПРЕСИЯТ. Няколко уводни думи за проекта pmeasyr. Можете ли да ни кажете как е възникнал този проект в AP-HP DIM? За да се постигне това, от което се нуждае PMSI анализът, настоящият софтуер за анализ и статистика на PMSI не отговаря ?
Здравейте, първоначалната идея беше да се съсредоточа върху софтуер, който с удоволствие използвам. Това не означава изоставяне на друг софтуер, но R може да концентрира повечето етапи на изследване: импортиране на данни, извършване на анализи, изготвяне на документ, представящ резултатите за тяхната комуникация. Прекалено често жонглираме между няколко софтуера, което е източник на грешки и объркване.
Следователно проектът е роден от необходимостта, която споделям с лекарите на Dim, стажантите в общественото здравеопазване и статистиците, за да има достъп до данни с определена свобода на използване на ниво престой, ако е възможно без софтуер на пазара. Тук няма да описвам подробно историята на проекта: по същество през 2016 г. създаването на група потребители на R сред Dim AP-HP отвори пакета за други потребители и направи възможно официалното използване на пакета. Изпълнено е излъчване извън AP-HP чрез github със следната идея: тези, които се нуждаят от такова решение, могат да го използват и да го подобрят, като участват, ако желаят.
Възможните заявки са доста неограничени (ограничени от потребителски идеи и данни). За да дадем пример, различен от представените на сайта, е доста лесно и бързо да се направи вътрешно/междуполево верижно обвързване и по този начин да се опишат пътуванията на пациента. Също така можем лесно да правим интерактивни карти и визуализации в R.
Кой екип в момента работи по разработката на pmeasyr в AP-HP ?
Аз съм разработчикът на pmeasyr и около мен има колеги статистици и лекари Dim, които използват пакета, носят ми своите идеи, забележки и коментари.
Бих искал да благодаря на членовете на групата R Users в AP-HP. По-специално, д-р Намик Таригт (централата на DIM - DOMU - AP-HP) за неговите насоки и идеи, д-р Кристел Коскер (HU Pitié Salpêtrière) за използването на пакета, неговата наличност и всички негови забележки, както и д-р Реми Flicoteaux (HU Saint Louis Lariboisière) за неговата мотивация и възможностите за работа, които предлага.
Работят ли IMG от различни заведения на AP-HP с pmeasyr? Какви са възвръщаемостта им ?
Някои AP-HP Dims използват пакета, тяхната обратна връзка ми позволява да подобря документацията и самия пакет. Положителните отзиви се отнасят именно до документацията, която позволява добър старт; Получих друга обратна връзка за лекотата на използване на пакета. По-негативната обратна връзка се отнася за годините, обхванати от пакета (началната година е 2011 г.), докато за някои клинични проучвания (кохорти) е необходимо да има по-стари данни: в този случай pmeasyr не е подходящ. Обяснявам тази отправна точка през 2011 г. с факта, че от тази година форматите стават по-хомогенни.
Имате ли контакт с други болници? Някой от тях вече работи ли или е предназначен да работи на pmeasyr ?
Имах контакти от няколко CH в цяла Франция. Открих това интересно измерение при отварянето на инструмент: взаимодействие с хора, упражняващи същата работа като нас, но в различни категории заведения. Техните въпроси са свързани с инсталирането на pmeasyr, формата на данните или са присъщи на инструментите ATIH и трансмисиите lamda и понякога се отнасят до R като цяло. Отзивите им за пакета са по-скоро положителни.
Когато отваряхме пакета, бяхме помислили за неговото използване в контекста на внедряването на GHTs: обединяване на PMSI данни (те са в един и същ формат), активност, активна опашка, проучване на пътуванията на пациента в интра GHT ...