Вашият микробиом живее тук - MyMicrobiome
Пикочо-половите пътища са невероятно придирчиви области на тялото, когато става въпрос за неговите обитатели. Вагиналният микробиом е изключително специализиран, позволяващ само няколко бактериални вида да живеят там. Въпреки че микробното разнообразие тук е много ниско в сравнение с други части на тялото, това е много уникална екосистема при хората, със задачата да поддържа pH в правилния диапазон и да държи враговете навън. Бактерията, която обича да живее там, принадлежи към вида Lactobacillus. Повечето жени имат една от 5 различни микробни общности, всяка от които е доминирана от вид Lactobacillus (L. crispatus, L. iners, L. jensenii или L. gasseri). Чрез освобождаване на млечна киселина и химическо оръжие (H2O2 и бактериозин), Lactobacillus предотвратява колонизацията на вредни организми като дрожди или патогенни бактерии.

Кожата на 1,8 м 2 е далеч по-сложна, тъй като обхваща много различни пейзажи, всеки с уникална екосистема.
Така наречените пустинни участъци на кожата (суха кожа като седалището, предмишниците или различни области на ръката) приютяват най-голямото микробно разнообразие, с 19 различни бактериални деления, четири от които са доминиращи (Actinobacteria (52%), Firmicutes (24%), Proteobacteria (17th) %) и Bacteroidetes (7%)). Тук има дори грам-отрицателни бактерии, за които първоначално се смяташе, че са замърсители от храносмилателния тракт. Интересното е, че филогенетичното бактериално разнообразие е по-голямо при суха кожа, отколкото в устата или храносмилателния тракт на същия човек.
Мазните области на кожата (себумните зони като челото, зад ухото, гърба и ноздрите) са основно колонизирани от пропионибактерии. Тези бактерии обикновено са безвредни, просто изпълняват защитата си срещу вражеските заселници. Пристигането на пубертета обаче кара хормоналните промени да променят химическата среда на кожата, особено на лицето. Тези промени водят до борба между имунната система и пропионибактериите, която се проявява в заразените себумни жлези и по този начин акне.
Влажната джунгла на кожата (влажни зони като пъпа, подмишниците, седалищната гънка, стъпалата, коленете и подмишниците) са дом на Corynebacterium и стафилококи. Въпреки че микробното разнообразие е по-ниско във влажните зони в сравнение със сухите кожни участъци, плътността на бактериите тук е най-висока с над 15 милиона бактерии в зона с размер на пощенска марка.
Много важен воин на кожата е Staphylococcus epidermidis, който работи активно с имунната система на кожата, за да задържи патогенните бактерии (например Staphylocuccus aureus). Както при всички екосистеми в нашето тяло, нарушаването на тази симбиоза може да причини заболяване. Кожните заболявания атопичен дерматит, акне вулгарис и хронични рани са добре известни примери за такава дисбиоза.
Устата е на входа на стомашно-чревния тракт. Вече тук живеят около 6 милиона микроорганизми, които могат да бъдат класифицирани в 4 основни подразделения (Firmicutes, Proteobacteria, Bacteroidetes, Actinobacteria и Fusobacteria). Тук бактериите се установяват в устната лигавица, по зъбите и по езика; всяка област е своя екосистема със свое отличително разнообразие. Като цяло в устата доминира един бактериален вид: стрептококи.
Поради високото съдържание на киселина, стомахът приема само бактериални популации с ниско разнообразие. Състои се главно от актинобактерии и хеликобактер (напр. H. pylori). В допълнение към регулирането на киселинността в стомаха, H. pylori регулира освобождаването на хормона грелин, който участва в регулирането на апетита. Ако тази бактерия липсва, има повишено производство на грелин и по този начин по-голям апетит.
За съжаление, H. pylori има лоша репутация за причиняване на стомашни язви при чувствителни индивиди през последните няколко десетилетия; бактерията е почти напълно елиминирана в стомаха ни с антибиотици, което обяснява повишената степен на затлъстяване при деца, особено в САЩ.
Ако се спуснем по-надолу към тънките черва и по-нататък към дебелото черво, броят на бактериите се увеличава драстично, колкото по-напред отиваме. Милиони пъти повече бактерии живеят в нашите черва, отколкото в кожата или в устата. Всъщност чревната стена не се вижда, защото е покрита с килим от бактерии.
В чревния микробиом преобладават бактерии от две филогенетични групи - Bacteroidetes и Firmicutes. Съотношението на тези групи бактерии помежду си варира значително от човек на човек и играе много важна роля при затлъстяването. По-висок дял на Firmicuten в сравнение с Bacteroides в червата е свързан със затлъстяването.
В допълнение към способността да използваме повече или по-малко енергия от храната си, чревният микробиом има и други много важни за нас функции. От една страна, това са метаболитни дейности като синтез на витамини, разграждане на химични вещества и хранителни вещества и подкрепа на метаболизма на мазнините. От друга страна, това е взаимодействието с нашата имунна система. Нашият микробиом се конкурира с вредните бактерии за хранителни вещества и пространство за заселване и се бори с вредните нашественици с химическо оръжие. Микробиомът също така стимулира имунната ни система да узрее.