SZTE и PTE съвместно изследват генетичните аспекти на Covid-19
Съвместна изследователска група на Университета в Сегед и Печ картира връзките между генетиката и тежестта на Covid-19.
- В проекта Covid-19 HUNGEN бих искал да разбера дали нашата генетика определя хода на коронавирусна инфекция при всеки човек: дори не забелязваме, че сме хванали коронавируса, или имаме лек симптом на инфекцията, или евентуално се развиват тежки усложнения - обясни целта на изследването проф. д-р Марта Шел е молекулярен биолог, ръководител на Института по медицинска генетика на Факултета по обща медицина на Университета в Сегед, професионален ръководител на съвместния изследователски проект на Университета в Сегед и Covid-19 HUNGEN.
През април изследователи от Университета в Сегед и Университета в Печ изготвиха план на проекта, който описва много подробно метода, критериите за подбор и изключване, които ще бъдат използвани за събиране на проби от 1000 пациенти, заразени с Covid, и как те ще бъдат обработени . Предполага се, че трябва да има генетично базирани, така наречените предразполагащи фактори, които допринасят за развитието на тежки заболявания при тези млади, инфектирани с Covid индивиди.
При съмнение за инфекция с Covid-19 се взема проба от фаринкса и след това се потвърждава чрез така наречения метод на полимеразна верижна реакция (PCR). След това от потвърдените заразени изследователите вземат още едно остъргване на фаринкса, за да определят целия геном на вируса. Изолираната нуклеинова киселина на вируса се поставя в биобанката на Университета в Сегед - това е част от колекцията от проби, разработена по време на проучването - и определянето на последователността е извършено в Университета в Печ от д-р. Извършва се от Атила Гинесей и неговата изследователска група.
В допълнение към фарингеалните остъргвания се взема кръв от всеки пациент и се правят три вида изследвания на взетата кръв. Те реагират например до степента, до която тялото на индивида е реагирало на вирусна инфекция чрез активиране на така наречения хуморален имунен отговор. В друго проучване общата РНК се изолира от кръвна проба, за да се определи как генетичният профил на експресията на гена на пациента се променя в кръвообращението в резултат на инфекция, т.е. какви гени се активират и кои гени се заглушават и до каква степен в резултат на инфекция. При третия тип тест геномната ДНК се изолира от кръвна проба. Пълното секвениране на екзома се извършва от изолираната геномна ДНК, така че пълната последователност на гена на пациента, кодиращ двадесет и една хиляди протеина, се определя за всеки пациент.