Средновековната фармакопея Простите и съединения за науката
Средновековните лекарства и рецепти за здраве черпят своя източник от смесица от древни знания, опита на монасите и работата на арабските учени и лекари.
Спящият мак (papver somniferum) е използван като успокоително или, под формата на сироп, като упойка (взето от De materia Medica от Dioscorides, I век).
Австрийска национална библиотека, Виена
Монасите от Средновековието са събрали остатъците от знанията на предците от Античността, както биха събрали парчетата от гигантска мозайка. Чрез тази търпелива работа по копиране те запазиха знания, които рискуваха да изчезнат при сътресенията на големите нашествия, последвали падането на Римската империя. Много от тези текстове са били на гръцки език, езикът на класическата медицина, който през ранното Средновековие едва ли някой е можел да чете на Запад. По този начин западните манастири са първите центрове за превод.
Най-известният от тези манастири, поне що се отнася до фармакопеята, е основан около 500 г. в Монте Касино в Централна Италия. В нейната внушителна библиотека се съхраняват писанията на Хипократ (460-370 г. пр. Н. Е.), Бащата-основател на емпиричната медицина, на римския лекар Клод Галиен (120-199), теоретик на патологията на настроенията, но също така и незаменимата фармакологична работа на Военен лекар от I век, Диоскорид от Аназарбос. Неговата Materia Medica описва около 1000 лекарства, лекарства, напитки, мехлеми, минерали и амулети. Западната терапия през ранното средновековие е била монастирска медицина.
Така образованите монаси искат да произвеждат собствени лекарства. През IX век големи култури от лечебни растения, включително мента, копър, градински чай и розмарин, се отглеждат по „идеалния план“ на бенедиктинския манастир Сейнт Гал. Приблизително по същото време Карл Велики също дава конкретни указания за отглеждането на лечебни растения във фермите на империята.
В мрежата от манастири се разпространяват медицински знания. Така около 1000 г. монасите от манастира Бенедиктбойрен поискали от братята си от езерото Тегерн семена за техните лечебни и зеленчукови растения.
Наблюденията на монасите се добавят към древни писания, като Книгата на лекарствата на Лорш, една от най-важните медицински суми от Каролингския период (вж. Карето на страница 70), или Науката за растенията от Уалафрид Страбон. (808-849), игумен на Райхенауския манастир. В стихотворение, озаглавено Hortulus („Малка градина“), последният пее химн на славата на 23 лечебни растения, включително тиква, мак, кервил и пъпеш. Игуменът лечител знае, че бялата лилия лекува ухапвания от змии, че пелинът лекува световъртеж, главоболие и треска и облекчава трудни диети. В началото на 12 век, в своята Естествена медицина, абатиса Хилдегард дьо Бинген (1098-1179) следва чистата традиция на клаустриновата медицина.
Християнското знание обаче е много по-малко богато от мюсюлманската аптека от същия период. Докато Европа се бори да опази наследството на Античността, на изток се появява нова култура. Отворени за писанията на гръцки и римски автори, несторианските лекари превеждат класически произведения на арабски. Това течение на християнската вяра, което дължи името си на своя основател Несторий (ок. 380-451), константинополски патриарх, се е отделило от гръко-римската църква и се е утвърдило в Гондишапур, източно от Персийската империя на Сасанидите . Оттам лекарите му пътуват до Багдад, столицата на абасидския халифат, където най-известният представител на несторианската школа Юхана Ибн Масауей (777-857) практикува изкуството си и пише първия трактат по офталмология на арабски. През IX век несторианецът Хунайн Ибн Исхак (808-873) превежда от сирийски на арабски писанията на Гален, наследниците на Хипократ, Диоскорид и византийските автори.
Именно въз основа на тези източници мюсюлманската фармация и медицина смесват патологията на настроенията на Гален и рационалната медицина от растения от по-стари училища в Източното Средиземноморие. Ibn Ishaq обобщава за училищна употреба Ars medicina на Гален в своето Въведение в медицината, което се превръща в класическа книга за преподаване и изпит на Изток.
Оттогава знаем, че аптека вече е съществувала в Гондишапур и се предполага, че около 800 г. Багдад също е имал такава. Там са построени първата болница (след 786 г.) и медицинско училище. В тази болница, посветена предимно на грижите за най-нуждаещите се, се приготвяха есенции и лекарства. Фармацевтите, които на пръв поглед също произвеждат парфюми и продукти от сандалово дърво, първоначално са служили като помощници на лекарите, но скоро те са получили известна степен на автономност, подлежаща обаче на строг контрол от администрацията. За да докажат своята компетентност, те трябваше да идентифицират лекарства, да знаят как да ги съхраняват и да овладеят теглилките и мерките. „Златното средновековие“ на мюсюлманската фармакотерапия (Х и ХІ в.) Са свързани с имената на известни арабски лекари и учени, като Хали Абас (? -994), Rhazès (865-925) и Авицена (980-1037).