Повишаване на разтворимостта на биологично активни пептиди с производни на олигоетилен гликол - PDF Free

Повишаване на разтворимостта на биологично активни пептиди с производни на олигоетилен гликол Докторска дисертация Ádám Bartos Ръководители: д-р Katalin Uray д-р Ferenc Hudecz MTA-ELTE Изследователска група по пептидна химия ELTE Катедра по органична химия ELTE-TTK Докторантско училище по химия Ръководител: Inzelt Györ Програма по синтетична химия, материалознание, биомолекулярна химия Ръководител на програмата: д-р Ищван Тамас Хорват 2008. 1

биологично

Благодарности Бих искал да благодаря: д-р Miklós Hollósi, д-р András Perczel, ръководител на катедрата, за това, че ми позволи да работя в катедрата по органична химия, Eötvös Loránd University, моите ръководители, д-р Ferenc Hudecz, научният съветник, ръководител на групата по пептидна химия MTA и д-р Uray д-р Hedvig Medzihradszky и д-р Szilvia Bősze за аналитични изследвания, д-р Gitta Schlosser за изследователска идентификация на пептиди чрез масова спектрометрия, Kata Horváti за масова спектрометрия и To Farkas Viktor и Dr. László Kocsis за полезните съвети и подкрепа. Бих искал да благодаря на докторантското училище на университета Eötvös Loránd за възможността за докторска работа и следните финансови ресурси ми позволиха да осъществя докторската си работа: TKA o K61518 05- 0183/3.0 GVP-3 .2.1-2004-04-0005/3.0. Благодаря на родителите ми, семейството ми, Рита, за търпението и спокойния фон, които ми помогнаха през докторската ми работа. 2

Списък на съкращенията Използвах съкращенията от 1 и 3 букви, използвани в литературата за съкращаване на аминокиселини (1). AAA AUC Boc BP Bzl CoA CM зона за анализ на аминокиселини под кривата t-бутилоксикарбонил бензотриазол-1-илокситрис (диметиламино) фосфоний хексафлуорофосфат бензил коензим с обща среда CP HC (Acm) VVVDVSHEDP-DCM DC-DCM DC-DCM-DCD-DCM-DCD-DCM DC-DCM дициклохексилурея DIC, -диизопропилкарбодиимид DIEA, -диизопропилетиламин DMAP 4-диметиламинопиридин DMF, -диметилформамид DMS диметилсулфоксид DMS диметилсулфоксид ED H-EVV -диамин EDT 1,2-етанолов етилацетат Етанол Етанол Етил Етанол Етил Етанол Етил Етанол Етил Етанол Етил Етанол Етил Етанол Етанол Етанол Етанол Етанол Етил Етанол Етанол Етанол Етанол Етанол Етанол Етилацетат Етанол Етилацетат Етанол Етилацетат Етанол Етанол Етилацетат спектрометрия Fc фрагмент кристализуем, константа на антитяло, константна област Fmoc 9-флуоренилметоксикарбонил 3

Fmoc-su HF HBt HPcp HPLC IC 50 ICM IgG MBHA MS MeH MTT HS MP Pcp PBMC PEG PyBP tbu TEG TFA TFMSA TTD TTD-Su 9-флуоренилметоксикарбонил - оксисукцинимид водороден флуорид 1-хидроксибензтриазол течност концентрация на мозъчна концентрация течност концентрация на мозъка концентрация на течност концентрация на мозъка 50% инхибиране безсерумна среда имуноглобулин G 4-метилбензхидриламинна смола масспектрометрия метанол 3- (4,5-диметилтиазол-2-ил) -2,5-дифенилтетразолиев bromidehydroxysuccinimidonpyrimenimyrpyrimimethylpyrimidylpyrimidylpyrimidylpyrimyrimethylpyrimidylpyrimidylpyrimidylmethylpyrr естер на периферни кръвни мононуклеарни клетки от периферна моноядрени клетки полиетиленгликол бензотриазол-1- илокситрипиролидинофосфоний хексафлуорофосфат t-бутил 3,6,9-триоксандекан-1,11-дикарбоксилна киселина трифлуороцетна киселина трифлуорометансулфонова киселина 4,7,10 амино-4,7,10-триокса-1,13-тридеканамид янтарна киселина VP H-VVDVVS H2Z бензилоксикарбонил 4

Съдържание 1. Въведение 8 2. Преглед на литературата 10 2.1. Поли- и олигоетилен гликоли 10 2.2. Взаимодействие и употреба на авидин с биотин 12 2.3. Имуноглобулин G протеини 15 2.4. Синтез на пептид в твърда фаза 17 2.4.1. Исторически преглед 17 2.4.2. Смоли 19 2.4.3. Структура на пептидната верига 21 2.4.4. Защитни групи на страничната верига 22 2.4.5. Методи за образуване на пептидна връзка 23 2.4.6. Проследяване на връзките 25 2.4.7. Отцепване на пептиди от смолата 26 2.4.8. Пречистване и идентифициране на пептиди 27 3. Цел и стратегия 28 4. Резултати 31 4.1. Резултати от синтеза на CP и VP пептиди 31 4.2. Резултати от синтеза на ED пептид 34 4.3 лигоетилен гликол производни 35 4.3.1 3,6,9-триоксаундекан-1,11-дикарбоксилна киселина (TEG) дистанционни елементи 36 4.3.1.1. Окисление на тетраетилен гликол 37 4.3.1.2 Хетерогенно фазово окисляване на тетраетилен гликол 37 4.3.1.3. Асиметрична защита на 3,6,9-триоксандекан-1,11-дикарбоксилна киселина (TEG) 38 4.3.1.4. Получаване на моно-Boc етилендиамин (Boc-EDA) и моно-fmoc етилендиамин (Fmoc-EDA) 40 4.3.1.5. Синтез на защитени разделители на базата на EDA-TEG в разтвор 41 4.3.2. Разделители на базата на 4,7,10-триокса-1,13-тридеканедиамин (TTD) 42 4.3.2.1. Създаване на структура с двойни йони 43 4.3.2.2. Разработване на Boc и Fmoc защита на разделител TTD-Su 45 4.3.2.3. Образуване на активен естер 46 4.3.2.4. Свързване на разделители, базирани на TTD 47 5