Микробно хранително отравяне - град Кьолн
Патогените като бактерии и плесени могат не само да заразят хората директно, но също така са в състояние да навредят на хората чрез образуването на токсин, който те отделят в храната.

Хранително отравяне, причинено от бактерии
Стафилококус ауреус
Ако тази бактерия попадне в или върху храната, тя може да образува токсин (стафилококов токсин). Този токсин преминава в храната. Тъй като токсинът е термостабилен, той няма да бъде елиминиран чрез кратко готвене. Ако човек погълне малки количества от тази отрова с храната си, може да възникне остро възпаление на чревната лигавица. Може да започне гадене, повръщане и диария. Тези симптоми могат да се появят само няколко часа след поглъщането на отровата. Краткото протичане на заболяването обикновено е доброкачествено.
Clostridium perfringens и Bacillus cereus
Отравянето е резултат от поглъщането на храни, които са силно замърсени с тези бактерии. Тогава се получава токсично образуване в храната и в човешките черва в резултат на бактериите Clostridium perfringens. Повръщане, коремни спазми и диария настъпват след осем до двадесет часа, които обикновено отшумяват след един ден.
Clostridium botulinum
Тези бактерии са по-склонни да произвеждат своя токсин (седем различни вида) в храната. След като бактериалният токсин се абсорбира с храната, тези токсини навлизат в кръвта и могат да причинят сериозно увреждане на нервните пътища. Развива се клиничната картина на ботулизма. Двойното виждане, нарушенията на преглъщането и дихателната парализа характеризират това заболяване. Отровата (тип А) на тази бактерия е една от най-мощните биологични отрови. Дори в най-малките дози (10-8 грама) е фатално за хората.
Хранително отравяне, причинено от плесен
Aspergillus flavus
Тази плесен произвежда отрова (афлатоксин), която изпуска в околната среда. Ако гъбичната трева се образува върху храната, отровата лесно попада в храната. Високите дози отрова (10 милиграма) могат да доведат до остра фатална чернодробна недостатъчност. Погълната като минимална доза в продължение на много години, тази отрова може да причини рак на черния дроб след десет до 20 години.