Варианти на Insig2, хранителни навици и метаболитен риск в Самоа - европейско списание за

метаболитен

  • Теми
  • Резюме
  • Контекст/цели:
  • Теми/методи:
  • Резултати:
  • Заключения:
  • Въведение
  • материали и методи
  • Проучване на популацията
  • Събиране на данни
  • Генотипиране
  • Анализ на данни
  • Резултати
  • Дискусия
  • Допълнителна информация
  • Word документи
  • Допълнителна таблица 1

Теми

  • Генетика на болестите
  • Проучване за генетична асоциация
  • Метаболитен синдром

Резюме

Контекст/цели:

Връзката на индуцираните от инсулин варианти на ген 2 (INSIG2) със затлъстяването е потвърдена в няколко, но не във всички последващи проучвания. Различията във факторите на околната среда между популациите могат да прикрият определени генетични асоциации и следователно трябва да се изследват взаимодействията между гените и околната среда. Предположихме, че връзката между хранителните навици и компонентите на метаболитния синдром може да бъде променена от варианти на INSIG2 .

Теми/методи:

Проведохме надлъжно проучване на риска от затлъстяване и риск от сърдечно-съдови заболявания при 427 и 290 възрастни в Самоа и Американска Самоа (1990-1995). Анализът на основните компоненти на хранителни продукти от валидиран въпросник за честотата на храните беше използван за идентифициране на съвременни и нетрадиционни хранителни навици. Проучихме взаимодействията между гените и диетите с вариантите INSIG2 rs9308762 и rs7566605.

Резултати:

Целта на това проучване е да се използва анализ на основните компоненти, за да се извлекат хранителните навици на населението на Самоанските острови и да се оцени тяхната връзка с метаболитното здраве, за да се повторят асоциациите, наблюдавани преди това в популацията от 2002 до 2003 г., и да се оцени за за първи път дали вариантите INSIG2, rs9308762 и rs7566605, модифицират тези асоциации. Сред четирите варианта на INSIG2, генотипирани преди това в тази популация, ние избрахме да се съсредоточим върху rs9308762 поради предишното ни проучване 32, което показа връзка с ИТМ и обиколката на талията, и върху rs7566605 поради многото предишни проучвания, проведени по този въпрос. нуклеотиден полиморфизъм (SNP) в други популации. 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31

материали и методи

Проучване на популацията

Проучваната популация се състои от възрастни на възраст от 25 до 55 години и четири баби и дядовци от самоански произход. Вече е докладвано подробно описание на това надлъжно проучване. 42, 43 Накратко, участниците са вербувани от 46 села и обекти в Американска Самоа през 1990 г. и девет села в Самоа (западна по това време) през 1991 г., последвани съответно 4 години по-късно през 1994 г. и 1995 г. На изходно ниво не всички участници са имали анамнеза за сърдечни заболявания, хипертония или диабет, който са се самоотчитали. Първоначално 563 и 694 души бяха вербувани в Американска Самоа, съответно през 1990 г. и 1991 г. в Самоа. През 1994 и 1995 г., когато бяха събрани данни за резултатите, 361 и 560 души бяха на разположение за проследяване, съответно след четири години в Американска Самоа и Самоа.

Получено е информирано съгласие от всички участници. Всички протоколи от проучването са одобрени от комитетите за контрол на човешките субекти в болница Miriam в Провидънс (RI), Министерство на здравеопазването на Американската Самоа и Министерство на здравеопазването на Самоа.

Събиране на данни

Генотипиране

Данни за генотипиране от четири етикета SNP, обхващащи 28 kb регион в INSIG2, включително rs7566605, вече са били налични за тази популация на изследването. 32 Подробности за генотипирането могат да бъдат намерени в Deka et al. 32

От четирите SNP, генотипирани и анализирани по-рано (rs756605, rs1352083, rs2161829 и rs9308762), само rs9308762, разположен в интрон 3 на INSIG2, е свързан с ИТМ и обиколката на талията в популацията, изследвана от Самоа. 32 Следователно ние фокусирахме нашия основен анализ на взаимодействията модел-диета върху този SNP. Въпреки това, ние също проучихме възможни взаимодействия между генетични и диетични модели с rs7566605, т.е. SNP, свързан със затлъстяването, в проучвания за асоцииране на други генетични групи на генома, като се предполага, че разликите в експозицията на околната среда могат да маскират генетични асоциации. r 2 и D 'за rs9308762 и rs7566605 са съответно 0, 37 и 0, 95, както бе посочено по-рано. 32 честоти на генотипа бяха в равновесие на Харди - Вайнберг.

Анализ на данни

Няма генетични разлики между самоанците и американските самоанци и генетично те могат да се считат за една и съща хомогенна популация без данни за субструктура на популацията, както показват предишните ни проучвания. 32, 44, 45 Съществуват обаче съществени икономически различия между двете страни. Тъй като тези икономически различия се отразяват на различните етапи на хранителния преход, решихме да проучим основните ни цели за стратификация на страните.