Технологии Omic, голямо развитие в хранителните изследвания на селскостопански животни - Revista
Използването на омически техники за изследване на ефектите от предизвикателствата и леченията върху животните на молекулярно ниво е основна грижа в изследванията на храненето на животните, както показва проучване, публикувано по тази тема от AllAboutFeed, подписано от д-р Марта Клунеман-мениджър изследвания по хранене Имунология Evonik.
Систематично знание
Тези нови видове анализи позволяват много по-задълбочени системни познания за биологията на животните и нейното взаимодействие с храната, но те носят и нови предизвикателства. това не е област на науката, а по-скоро набор от методи, използвани за измерване на експериментални субекти в конкретни изследователски теми.
В основата си техниките на Omice имат за цел да измерват общия състав на определена биохимична група: (мета) геномика за ДНК, транскриптомика за РНК, протеомика за протеини, метаболомика за малки хидрофилни съединения и липидомика за малки липофилни съединения.
Физико-химичните свойства на химичните единици, които представляват интерес, определят използвания аналитичен метод. Следователно в Omics има разделение между базирани на секвениране методи за ДНК и РНК и особено методи, базирани на масспектрометрия за протеини, метаболити и липиди.
Набор от методи
Технологиите Omic не са област на науката, а по-скоро набор от методи, използвани за измерване на експериментални субекти в конкретни изследователски въпроси.
При всички методи обаче способността да се измерват много молекули се търгува със способността да се измерва абсолютната концентрация на тези молекули. Допълнителните компенсации представляват ограничена чувствителност за методите, базирани на секвениране и по-ниска точност за методи, базирани на масспектрометрия в сравнение с техните целеви аналози.
По-специално, поради количеството генерирани данни в сравнение с класическите аналитични методи, визуализирането на данни и резултати с графики е съществена стъпка при всеки анализ на данните от Omics. Обикновено анализът на главния компонент (PCA) или анализът на главните координати (PCoAs) се използват за изследване на общите разлики между пробите и за показване на ефекта от експерименталната обработка върху обекта на Omics, който се изследва.
Класификация на гените
За статистически значими ефекти, топлинните проби са полезни за насочване на избора на интересни молекулни модели. Освен това изследователите класифицират гени и други молекули според свързана функция, която е описана преди това от други изследователи и е събрана в бази данни.
Често молекулата участва в много процеси и процесът се състои от няколко молекули. Тези връзки много към много затрудняват интерпретацията на данните, но като внимателно обмислят биологичния контекст, тези пътеки асоциации могат да насочат изследователя към полезна и проверима хипотеза за вътрешната работа на изследваните проби.
Фундаменталната реализация на омическата технология е, че фенотипно наблюдение на съставните наблюдаеми черти или характеристики на организма), в проучване върху животни, може да се комбинира с измервания на повечето молекули, съставляващи биологичната среда в пробата. По този начин визуалните и други известни разлики между пробите могат да подкрепят интерпретацията на омичните резултати и могат да доведат до заключение, което обяснява молекулярния механизъм, който определя фенотипа.
Инструмент за изследователи
Въпреки това, докато методите "Omics" дават представа как се променя цялата изследвана биологична система, не е най-добрият избор да се покаже как се променя конкретна част от системата.
По този начин целевите методи или нов целенасочен експеримент трябва да допълнят класическите тестове с методите на Omice, за да се проверят хипотезите от самите резултати на Omice.
Освен това методите на Omice не могат да заменят фенотипна находка, като например по-добро съотношение на конверсия на фуража или по-бърз отговор на ваксинацията, но те могат да насочат изследователя към целенасочена, проверима хипотеза за основния молекулен механизъм.