Отбранителни сили и отбранителна лига
Отбранителните сили и Лигата на отбраната участват най-пряко в подготовката на военната държавна отбрана.
В мирно време отбранителните сили трябва да охраняват територията на Естония и да упражняват надзор и контрол на въздушното пространство, да осигуряват необходимата готовност за отбрана и военна подготовка на военнослужещите за набиране на резервни части, както и да участват в международни операции и да подпомагат гражданските сили при елиминирането на последствия от бедствия, причинени от природни бедствия или човешка дейност.
При криза или война задачите на отбранителните сили включват военната отбрана на държавата, осигуряване на необходимите условия за пристигане на съюзническите сили и оказване на помощ на приемащата държава.
Силите за отбрана се състоят от три вида войски: сухопътни сили, военноморски сили и военновъздушни сили. В допълнение към тях отбранителните сили включват подразделения от централното подчинение на Съвместното учебно заведение на отбранителните сили, Логистичния център, Щабът и батальона за връзка и Военната полиция. Силите за отбрана са комбинация от части, съставени от резервна армия и професионални войници. Професионалните военни гарантират на държавата способността да реагират бързо и да участват в международни операции, а резервните части - наличието на необходимата военна сила в ситуация на война или криза.
За изпълнение на задачите силите на отбраната са разделени на административно-тренировъчни и оперативни структури. Структурата на административното обучение е предназначена да разработи оперативната структура и да подкрепи цялостната дейност на отбранителните сили. Оперативната структура е предвидена за подготовката и, ако е необходимо, и изпълнението на военната защита. В мирно време повечето от подразделенията, съставляващи оперативната структура, са в резерв. Броят на оперативната структура е 16 000, която може да бъде разширена с повече от 30 000 обучени отбранителни сили в допълнителния резерв. В мирно време броят на военнослужещите в отбранителните сили е приблизително 5500, от които приблизително 2000 са военнослужещи.
Сухопътни сили
Сухопътните войски са основният тип на естонските отбранителни сили (OVE), състоящ се от щаб, четири отбранителни района и 1-ва пехотна бригада. 1-ва пехотна бригада включва и единствения батальон от отбранителните сили, състоящ се от професионални войници - скаутския батальон. Основната задача на сухопътните войски в мирно време е да провеждат обучение, а по време на война или криза - да се подготвят за необходимите действия и да участват във външни операции. В контекста на воденето на военни действия задачата на сухопътните войски включва защитни действия независимо или в сътрудничество със съюзническите сили. Отбранителният район е военна част с териториална отговорност, назначена още в мирно време. По този начин сферата на отговорност на Северния отбранителен окръг е окръзите Талин, Харю и Рапла, Североизточната ПА - окръзите Ида-Виру, Лаане-Виру и Ярва, Южната ПА - Вируски, Пълва, Валга, Тарту, Йегева и Окръзите Вилянди, под отговорността на Западния ПА, включват окръзите Пярну, Ляане и Сааре. В отбранителната област се включват и центрове за подготовка на мирно време за сухопътни войски, разположени в зоната им на отговорност. По този начин Северният отбранителен район включва гвардейския батальон (изт. Vahipataljon), Южният отбранителен район включва пехотния батальон Kuperjanovi (изт. Kuperjanovi jalaväepataljon) и пехотния батальон Viru от североизточната PA (Est. Viru Sujalaväkepataljon),), противовъздушна отбрана Батальон (изт. Õhutõrjepataljon) и инженерен батальон (изт. Pioneeripataljon). В допълнение, всеки ПО включва също център за управление на тила, който поддържа техните дейности. Отбранителните области играят водеща роля в обучението на военнослужещи, подготовка на резервисти и провеждането на многократни учения за резервни части. Пехотната бригада и отбранителната област са еднакви по размер. Основната разлика е, че бригадата в мирно време няма конкретна зона на отговорност и въз основа на нейната структура и оръжия може да бъде по-бързо реформирана на цялата територия. Бригадата е най-голямото тактическо подразделение на естонските отбранителни сили.