Изненадващо откритие за ХИВ
Учените смятат, че ХИВ или човешкият имунодефицитен вирус, който причинява СПИН, е започнал да заразява хората в Централноафриканския регион някъде в началото на 1900 г., разпространявайки се върху хората от шимпанзетата. Има период от най-малко 80 години от момента, в който ХИВ вирусът е започнал да се предава на хората до откриването му и следователно голяма част от динамиката на мутациите, претърпени от този вирус в началото остава неизвестна.
Наскоро обаче най-старият почти пълен геном на вируса на ХИВ беше открит в Демократична република Конго, в забравена тъканна проба от 1966 г., почти две десетилетия преди ХИВ вирусът да бъде официално открит, съобщава Agerpres. Информацията е публикувана от Live Science, като се позовава на проучване, публикувано в последния брой на Proceedings of the National Academy of Sciences.
Пробата от тъкан е взета и консервирана през 1966 г., което прави този вирусен геном на ХИВ с 10 години по-стар от най-стария известен ХИВ геном до момента (от кръвна проба, събрана през 1976 г. от ДР Конго).
Защо е важно да се проследяват генетичните мутации във вирус
Такива геномни последователности, които идват от период преди откриването на вируса, който причинява СПИН (откритие, извършено през 1983г), допринася за идентифицирането на генетични мутации, претърпени от този вирус. На свой ред, тези мутации помагат на изследователите да проследят как ХИВ се разпространява и кога е започнал да заразява хората.
От тази гледна точка новооткритата геномна последователност е много уместна, според Софи Гризълс, съавтор на новото изследване и постдокторант по еволюционна и изчислителна вирусология в Католическия университет в Льовен (KU Leuven), Белгия. Тази последователност съответства на начина, по който изследователите установяват периода на появата на ХИВ при хората, каза тя в изявление за Live Science.
„Хубаво е да се знае, защото това означава, че нашите еволюционни модели, които прилагаме към вирусната последователност, работят добре. Не срещнах големи изненади ", подчерта тя.
Има няколко щама на ХИВ, но подгрупата, отговорна за 95% от случаите на СПИН по света, е ХИВ-1 група М. Над 32 милиона души по света са починали от СПИН от началото на тази пандемия.
И как има период от най-малко 80 години от момента, в който ХИВ вирусът започва да се предава на хората до откриването му, голяма част от динамиката на мутациите, претърпени от този вирус в началото остава неизвестна.
Когато вирусът стана вирулентен?
Математическите модели на скоростта на мутациите във вируса дават някои улики за това кога е започнало предаването на ХИВ от човек на човек, което след това се е превърнало в пандемия. Но остава един въпрос: кога и защо ХИВ-1 подгрупа М стана толкова плодовита, че успя да зарази толкова много хора в световен мащаб.?
Част от този проблем е, че математическите модели, които успяват да изчислят степента на мутациите, претърпени от вируса през последните години, стават много по-малко точни, ако се вземат предвид за по-дълги периоди от време, според Софи Гризълс. Това е свързано с факта, че генетичната информация се губи за по-дълги периоди от време. Определени вирусни щамове изчезват просто поради естествен подбор или просто поради случайни фактори, като не оставят следа от тяхното съществуване в геномите на циркулиращите в момента вируси.
Поради тази причина, откриването на древен вирусен щам е като откриването на археоптерикс за палеонтолозите. Липсва част от пъзела за това как това семейство вируси се е развило с течение на времето.
Софи Гризъл се присъедини към текущ проект, ръководен от биолога Майкъл Уробей от Университета в Аризона и, заедно с други изследователи от Белгия, САЩ и ДР Конго, анализира 1645 проби от тъкани, събрани от региона на Централна Африка по време на биопсия. 1958 - 1966 г. Взетите проби са консервирани във формалин и след това покрити с парафинов восък. След това, използвайки PCR тестове (подобни на тези, използвани за откриване на новия коронавирус), изследователите търсят следи от ХИВ генома. В крайна сметка те открили само една такава следа: вирусна последователност при биопсия на лимфни възли от 38-годишен мъж.
Защо новото откритие е важно и какво трябва да определят изследователите
Има и по-стари вирусни фрагменти на ХИВ - един от 1959 г. и друг от 1960 г., също от ДР Конго. Но това са непълна и по подразбиране те не могат да предоставят информация за мутациите, които този вирус е претърпял с течение на времето. Тези два фрагмента също са част от различни подтипове на ХИВ, според Gryseels, което доказва това този вирус циркулира в хората от преди 50-те години.
Следващата цел на изследователите е да разберат когато вирусът ХИВ-1 започна да се разпространява бързо, епидемия. Възможно е да има някои промени в генома на вируса HIV-1, които са го направили по-ефективен, според Софи Гризълс. Но по-вероятно, промени в човешкото общество те направиха това възможно.
урбанизация нараства бързо в началото на ХХ век в Централна Африка.
Между 1910 и 1950 г. стават достъпни кампании за обществено здраве лечения за състояния като малария, нарушения на съня и сифилис. Но много от тези кампании не използват ефективно стерилизирани медицински инструменти, което би могло да доведе до разпространението на ХИВ.