HPV ваксинацията може да причини преждевременна яйчникова недостатъчност (менопауза)
От известно време друг възможен страничен ефект осакатява ситуацията: въз основа на доклад за случай, публикуван в 6 медицински списания, може да се заключи, че ваксинацията срещу HPV, макар и рядка, може да причини необратима менопауза при юноши. Съобщенията за случаи може да са само върхът на айсберга, тъй като много млади жени приемат контрацепция, която маскира менопаузата за дълго време. Вирусът също не може да бъде истински опроверган, тъй като производствените компании никога не са изследвали ефекта на ваксинацията върху сексуалната активност в дългосрочен план.

Serena Colafrancesco et al. (2013) описва случая с три други млади жени, които също са имали симптоми, характерни за HPV ваксинацията (подуване, главоболие, сънна апнея, холецистит) след ваксинация. Всички те бяха здрави преди ваксинацията и не страдаха от никакво заболяване или наследствено разстройство, което би обяснило прекратяването на менструалния им цикъл. Хормоналното рестартиране на менструалния цикъл също се оказа неефективно. Преди спирането на менструацията, менструацията за първи път стана нередовна и като че ли имаше леко кървене. Едно от младите момичета имаше симптоми след първата ваксинация, но също така получи още две ваксинации.
На възраст под 20 години изчерпването на яйчниците се наблюдава при 10 000 жени. За отбелязване е, че и във всичките шест случая този рядък проблем е последван от HPV ваксинация всеки път.
Еднодневно проучване изследва 53 жени, които съобщават за появата и появата на изправено кръвно налягане два месеца след ваксинацията срещу HPV. 48% от тези, които не са използвали контрацепция, съобщават за болезнена менструация, нередовен цикъл и много силен менструален период (Brinth et al. 2015).
Малко съобщава, че за разделно доставяне компанията, която подкрепя проучванията за безопасност на четирикомпонентната HPV ваксина, признава, че има два случая в опити 011 и 012, при които са настъпили два случая на аменорея (т.е. цикъл).
След въвеждането на Gardasil през 2006 г., 213 нежелани реакции са докладвани на VAERS (система за докладване на нежелани събития при ваксини), при които менструация (аменорея) и съобщава се за ранна яйчникова недостатъчност и в 88% от тези случаи Gardasil е ваксината. Двата компонента Cervarix представляват 4-8% от съобщените случаи. В периода преди ваксинацията срещу HPV, между 1990 и 2006 г., са докладвани общо 32 случая на аменорея и липса на яйчникова недостатъчност. Намалявайки случаите до персистираща аменорея или изтощение на яйчниците, във VAERS има 89 случая, от които 86 могат да бъдат свързани с Gardasil (Scott and Field, 2016)).
Как ваксината може да причини овариална недостатъчност?
Няколко изследователи предполагат, че алуминиевият адювант предизвиква автоимунни процеси при предразположени индивиди, това се нарича ASIA синдром (Gruber and Shoenfeld, 2015). Colafrancesco йs mtsi. (2013) изведе от трите случая, че случаите отговарят на критериите за синдром на ASIA. Наличието на автоимунитет може да бъде демонстрирано в два случая.