Фекален микробиом - подробности за биоклиничния анализ

Тестът може да се извърши най-малко 7 дни след края на антибиотичното лечение, но препоръчителният интервал е 14 дни.

Поради ограничения период на стабилност, препоръчително е вземането на проби и пренасянето на пробата в лабораторията да се извършва САМО в понеделник и вторник до 14.00.

Биоклиника в Тимишоара: Пробите ще се вземат в понеделник, вторник и сряда до 14.00.

Резултат на английски език за максимум 15 работни дни от момента, в който пробата пристигне в партньорската лаборатория, която извършва анализа.

За този тест понастоящем няма референтни стойности за деца под 3-годишна възраст.

Пакетът се изпраща 1 седмица (сряда) от Тимишоара.

Относно анализа - Микробиом във фекалиите

Общ преглед

На чревно ниво има голямо разнообразие от бактерии, гъбички и други микроорганизми (до 1000 вида). Здравият възрастен има уникална микробиота, която е относително стабилна във времето. Въпреки големите междуиндивидуални различия, има някои данни, които характеризират балансирана микробиота. Важна характеристика е преобладаването на задължително анаеробни бактерии, които принадлежат към филогенетичния подразделение Bacteroidetes (напр. Bacteroidaceae и Prevotellaceae) и Firmicutes (например Clostridia, Ruminococcaceae и Eubacteriaceae). Актинобактерии и протеобактерии (Enterobacteriaceae и Fusobacteria spp.) Също така могат да бъдат идентифицирани в случай на балансирана микробиота, но са с ниско значение.

Разнообразие

Разнообразието на микробиома се показва от разнообразието от микроорганизми, които той съдържа. Като цяло голямото разнообразие на микробиотата е показател за здравословна чревна флора. Намаленото физиологично разнообразие може да е проява на дисбиоза, често свързана с увеличаване на потенциално патогенните бактериални видове (които не принадлежат към класовете Bacteroidia или Clostridia). Хранителните навици влияят върху чревната флора, благоприятствайки развитието на някои бактериални видове. Човешкият чревен микробиом е разделен на три ентеротипа, които съответстват на доминиращите бактерии. Независимо от националността, пола, възрастта и телесното тегло, има връзка между микробите, които доминират количествено, и останалото съдържание на микробиоми.

Класификация

Ентеротип I: преобладаващият микроорганизъм е Bacteroides spp., често свързан с Parabacteroides, като енергията се генерира главно от въглехидрати и протеини, чрез процеса на ферментация.
Ентеротип II: преобладаващият бактериален вид е Prevotella spp., често свързан с Desulfovibrio spp. (тези бактерии имат способността да разграждат муцин в чревната лигавица).
Ентеротип III: доминиращият микроорганизъм е Ruminococcus spp., с честото присъствие на Akkermansia. Въглехидратите, получени след разграждането на муцина, се абсорбират, пресичайки клетъчната мембрана чрез специални транспортни механизми.

Въпреки че витаминният биосинтез присъства във всичките три ентеротипа, ентеротип I произвежда биотин, ентеротип II произвежда тиамин, а ентеротип III участва в биосинтезата на хема. Някои автори посочват, че дългосрочните хранителни навици могат да променят вида. В някои проучвания ентеротипът, доминиран от Bacteroides spp., Е свързан с ентеротипа, доминиран от Ruminococcus.

Чревни нарушения

Възпалително заболяване на червата

Колоректален рак

Различни публикации описват непропорционалния вид на някои бактерии във фекалиите при пациенти с колоректален рак. Някои автори обсъждат възможността за използване на микробиома като метод за скрининг на колоректален рак. В сравнение със здравите хора, количеството Fusobacterium (особено F. nucleatum) се увеличава. Този аспект се наблюдава и в случая на Porphyromonas asaccharolytica и Peptostreptococcus stomatis. Фирмикутите, особено родът Clostridia, се отчитат в малък брой, подобно на Actinobacteria. В някои проучвания съобщенията за наличието на Bacteroidetes варират. Bifidumbacterium spp. Изглежда положителен регулатор на антитуморния имунитет.

Синдром на раздразнените черва

Пациентите със синдром на раздразнените черва обикновено имат повишено съотношение Firmicutes/Bacteroides. Този аспект се демонстрира и при депресия, така че може да се обсъди разстройство на оста "мозък-черва". Проучванията показват, че бифидобактериите често намаляват в количество, докато промяната в броя на Bacteroides, Lactobacilli и E. coli не е много ясна. Процентно увеличение може да се наблюдава в случай на щамове на Ruminococcus spp. И Alistipes spp.

Некротизиращ ентероколит

Некротизиращият ентероколит е тежко заболяване при новородени, с повишен процент на заболеваемост и смъртност, особено често при недоносени деца (родени преди 32 седмица от бременността) и бебета с ниско тегло при раждане. Некротизиращият ентероколит включва възпалително заболяване на чревната лигавица (тънко и дебело черво), причинено от бактерии. Многобройни проучвания показват, че могат да настъпят типични промени в чревната флора до 3 седмици преди клиничното проявяване на заболяването. Например, значително увеличаване на броя на Enterobacteriaceae, особено Klebsiella spp., Може да се счита за предупреждение относно развитието на болестта. Увеличаването на броя на Clostridium perfringens предполага риск за развитието на болестта с много по-тежки прояви. Бифидобактериите и лактобацилите се намират в малки количества в изпражненията на засегнатите новородени.

затлъстяване

Разнообразни публикации свидетелстват за връзката между затлъстяването и промените в състава на чревния микробиом. Чрез ефективно разграждане на неусвоените хранителни вещества, чревните бактерии могат да осигурят на тялото допълнителна енергия. Особено бактериите, принадлежащи към клъстера Firmicutes, могат да метаболизират диетичните фибри в късоверижни мастни киселини. Повишеният брой Firmicutes може да доведе до по-голямо усвояване на калориите, като по този начин причини увеличаване на теглото. При хората с наднормено тегло се наблюдава повишено съотношение Firmicutes/Bacteroidetes и ниско алфа разнообразие на чревния микробиом в сравнение с индивидите с нормално тегло. През последните години при индивиди с наднормено тегло са идентифицирани редица количествено редуцирани бактериални видове (напр. Akkermansia muciniphila, Lactobacillus gasseri, Faecalibbacterium prausnitzii, Bifidobacterium, Lactobacillus, Butyrivibrio, Alistipes, Akkermanshan, Coprocv).

Диабет тип 2

Диабет тип 2 е нарушение на въглехидратния метаболизъм, при което инсулинът присъства, но има нисък клетъчен ефект. Тази инсулинова резистентност води до повишаване на кръвната захар. Затлъстяването е основен рисков фактор за това състояние. Точната патогенеза на заболяването не е напълно известна. Типични промени в чревния микробиом са наблюдавани при пациенти със затлъстяване с диабет тип 2. Последните публикации показват, че тези промени в чревната флора са пряко свързани с патогенезата на диабет тип 2. Поради нарушение на чревната пропускливост, бактериалните компоненти поддържат ниско ниво на възпаление, наблюдавано при затлъстяване и диабет тип 2. което е засегнато чревната пропускливост при хора с диабет и затлъстяване не са напълно известни.

Сърдечно-съдови заболявания

Последните проучвания са установили връзка между чревния микробиом и атеросклерозата. Метаболитите (холин, фосфатидилхолин и L-карнитин) в храната се метаболизират от чревния микробиом до триметиламин, който ще се окисли от черния дроб до триметиламин N-оксид (TMAO). В проучването на Framingham Heart този метаболит е показан като един от малкото серумни параметри с прогностична стойност за по-нататъшното развитие на сърдечно-съдово заболяване при все още здрави пациенти. Бактериите, отговорни за образуването на триметиламин, не са напълно идентифицирани, но изглежда, че Desulfovibrio desulfuricans и Tenericutes участват в този процес. В допълнение, увеличаването на пропускливостта на чревната лигавица за бактериални метаболитни продукти може да доведе до хронично възпаление на артериалната стена. При болни пациенти е установен висок процент на бактерии от рода Collinsella, докато Eubacterium, Roseburia и Bacteroides spp. Присъстват главно при здрави хора.

Ревматоиден артрит

Редица проучвания показват, че хората с ревматоиден артрит имат ниска честота на групите Bacteroides-Porphyromonas-Prevotella и Eubacterium rectale - Clostridium coccoides. Lactobacillus и Prevotella spp., Особено P. copri, могат да присъстват в ранните стадии. В острите фази на заболяването може да се наблюдава повишен дял на Lactobacillus salivarius, Gordonibacter pamelaeae и Clostridium asparagiforme, съответно намалено присъствие на Haemophilus spp.

Комплексният анализ на микробиома се извършва от изпражненията по метода от следващо поколение Секвениране от следващо поколение (NGS) и позволява идентифицирането на всички микроорганизми, които се намират в червата (до 1000 различни вида). Здравият възрастен има уникален, относително стабилен микробиом през целия си живот.

Ролята на чревния микробиом

Играе важна роля в ежедневието и осигурява правилното функциониране на човешкото тяло (синтезира витамини - В1, В2, В6, В12, К2, К, Н и незаменими аминокиселини)
Елиминира метаболитните продукти
Осигурява калории (до 10%)
Борба срещу патогени

Всеки човек има уникален микробиом, подобен на пръстовия отпечатък. На чревно ниво има 10 милиарда бактерии (10 пъти повече от клетките в човешкото тяло). Тези бактерии съдържат> 3 милиона гени, 150 пъти повече гени от човешкия геном (ДНК); теглото им може да надвишава 2 кг.