Дидие Раул; Олег Медианников; IHU

Изследване на човешка микробиота и култура на придирчиви бактерии

Екип 1 UMR D-258, Микроби, Еволюция, Филогения и Инфекция (MEPHI)
Университет Екс-Марсилия (AMU), Изследователски институт за развитие (IRD)

олег

Ръководители на екипа:
Членове
  • БРЕЖЪН Фабиен
  • DAVOUST Бернар
  • ЕДУАР Софи
  • LAGIER Жан-Кирстоф
  • МЕРХЕЙ Вики
  • МИЛИОН Матю

1. Научна стратегия и проекти

Културата остава основен елемент във всички изследвания в областта на микробиологията и инфекциозните болести (5). По този начин, в допълнение към увеличаването на репертоара от бактерии в микробиотата, културомиката даде възможност за различни приложения. От една страна, някои от тези нови бактерии са открити в нашата клинична лаборатория по микробиология в ситуации на инфекции (6). От друга страна, някои щамове от нашата колекция, култивирани от културомици, са били полезни за проекти, разработени от екип от Института на Гюстав Руси в тяхната работа върху връзката между микробиотата и ефикасността на имуномодулиращото лечение на рака (7).

  • Микробиота и хранене

Храненето е основен определящ фактор за човешката микробиота. Нашият екип първо проучи връзките между нарушената микробиота и затлъстяването. За първи път показахме намаляване на метаногенните Archaea, Bifidobacterium включително B. animalis и Lactobacillus casei при затлъстяване (8). Тези 2 вида (L. casei, B. animalis) са особено важни в храненето, тъй като те са двата вида, най-често предлагани на пазара като пробиотици в света. И обратно, установихме, че вид Lactobacillus: L. reuteri, е свързан със затлъстяването (8).

Проучването на измененията на микробиотата при тежко остро недохранване ни позволи да подчертаем загуба на анаеробни микроби и метаногенни археи (9). Успяхме да свържем това с промяна на физикохимичните условия в храносмилателния тракт с увеличаване на редокс потенциала (окисляване на храносмилателното съдържание). Възможно е това окисляване, вероятно свързано с дефицит на антиоксиданти в храната и отговорно за оксидативен стрес, да причини необратима загуба на някои храносмилателни микроби, полезни за детето. На второ място, ние идентифицирахме кои бактерии са загубени от Microbial Culturomics и предложихме пробиотичен коктейл от 13 вида, съдържащ 5 млечни бактерии (Bifidobacterium adolescentis, Lactobacillus parabuchneri, L. perolens, L. vacuuminostercus и Weisselle confusa), но също и анаероби, произвеждащи бутират (10 ). Този коктейл може да бъде предложен за лечение на случаи на тежко остро недохранване, неустойчиво на терапевтичния режим.