Визуализиране на сходството на човешка и химическа ДНК; EWST Превод

Калифорнийски университет - Ривърсайд
Ривърсайд, Калифорния 92521

човешка

Неотдавнашната публикация на пълния геном на шимпанзе, белязана от брой на списание Nature, ни казва, че хората и шимпанзетата имат 96% от един и същ генетичен материал. Този брой е труден за разбиране, което означава, че ние споделяме 96% от нашата ДНК с най-близките ни живи братовчеди.?

Директното изследване на ДНК не е полезно. Например, разгледайте първите 100 базови двойки на полето на митохондриалната ДНК:

gtttatgtagcttaccccctcaaagcaatacactgaaaatgtttcgacggggtttacatcaccccataaacaaacaggtttggtcctagcctttctattag ...

и първите 100 основни двойки човешка митохондриална ДНК:

gatcacaggtctatcaccctattaaccactcacgggagctctccatgcatttggtattttcgtctgggggtgtgcacgcgatagcattgcgaggg

Приликата е много трудна за оценка и пълният геном както за хората, така и за шимпанзетата всъщност е около 3 милиарда дълги базови двойки.!

Изградихме прост инструмент, който позволява на хората да визуализират и разберат сходството/различието на ДНК последователностите. Въпреки че понастоящем тази статия не е публикувана и все още е в ход, ние пуснахме видеоклип за човешка и шимпанзе ДНК, за да съвпадне с публикуването на пълния геном на шимпанзетата.

Видеото продължава около 2 минути и е напълно автономно. По-долу е версията на Youtube, може да предпочетете да видите по-долу самостоятелните версии с по-висока разделителна способност.

  • Google Video е тук .
  • Пуснете версията Quicktime в браузъра: Внимание, най-доброто качество, но голям файл. Може да отнеме няколко минути преди възпроизвеждането на видеоклиповете.
  • Пуснете AVI версията в браузъра.
  • Пуснете MP4 версията в браузъра.
  • Щракнете с десния бутон на мишката, за да изтеглите Quicktime версия: Внимание, голям файл (безплатен плейър).
  • Щракнете с десния бутон, за да изтеглите AVI версия
  • Щракнете с десния бутон, за да изтеглите MP4 версията

Кратка биография на участниците:

  • Д-р Eamonn Keogh е асистент по компютърни науки в UCR. Неговите научни интереси включват извличане на данни и визуализация.
  • Д-р Стефано Лонарди е асистент по компютърни науки в UCR. Неговите научни интереси включват изчислителна молекулярна биология.
  • Д-р Виктор Б. Зордан е асистент по компютърни науки в UCR. Неговите изследователски интереси включват компютърна графика.
  • Д-р Санг-Хий Лий е асистент по антропология в UCR. Неговите научни интереси включват човешката еволюция и таксономия.
  • Манел Джара е студент в Автономния университет в Барселона и е бил студент в UCR през 2005 г.

Ако искате да споменете този документ, моля, използвайте:

E. Keogh, S. Lonardi, VB Zordan, SH Lee и M. Jara (2005). Визуализиране на сходството на човешка и химическа ДНК. (Мултимедийно видео). http://www.cs.ucr.edu/

Благодаря на Колин Креншоу, Бил Юан-чи Чиу и Анвар Ади за помощта и предложенията. Музиката във видеото е Шопен - Балада № 4 фа минор, Op.52, Andante con moto, изпълнена от д-р Санг-Хий Лий .