Василий Шуйски
Боляр цар Василий Шуйски
Проблемите в Русия набираха сила. На страната беше наложен нов цар - Василий Шуйски, който страстно мечтаеше за трона от края на династията Рюрикови. Непривлекателната му външност се вижда особено в историята на Царевич Дмитрий: през 1591 г. той удостоверява, че царевичът се е самоубил; по време на превземането на Москва от самозванеца каза, че Дмитрий е избягал; сега твърди, че момчето е убито по подбуда на Годунов.
Три дни след убийството на самозванеца, хората на Москва се събраха на Червения площад, за да решат съдбата на управлението на страната. Някои се застъпваха за прехвърлянето на властта на Патриарха, други на Боярската дума, но хората на Шуйски също активно работеха в тълпата. Именно те извикаха името му като бъдещ крал. И тогава поддръжниците на Шуйски подхванаха този вик. Така съдбата на кралската корона беше решена.
През 1606 г. Василий Шуйски става, подобно на Годунов, избран руски цар. Шуйски назовава казанския митрополит Хермоген, страстен привърженик на православието, ненавистник на самозванеца и католици, на руския патриарх.
Московските боляри мечтаеха за преход към система за избор на върховна власт от аристокрацията. Това беше потвърдено от целувката на Василий Шуйски: Целувам кръста поради факта, че не трябва да правя нищо лошо над никого без катедрала.
Ето как мощно и противоречиво движение на всички слоеве на обществото определи опита на Русия да премине от автокрация и деспотизъм към болярско колективно управление.
Гражданска война
Идването на власт на болярския цар допълнително засили Смутията. Придружителите на Лъже Дмитрий не искаха да се откажат от това, което бяха завладели. Имаше слух, че кралят е избягал и се е приютил на сигурно място.
Центърът на антибоярските настроения беше град Путивл, където княз Шаховской, приятел на Лъже Дмитрий, беше управител. Рязан, Йелец и други градове подкрепиха Путивл. А в Полша се появи благородникът Молчанов, един от убийците на Фьодор Годунов и близък приятел на самозванеца, който започна да се преструва на избягалия „цар Дмитрий“.
През лятото на 1606 г. мощно въстание обхваща цяла Южна и Югозападна Русия. По същество започва гражданска война, в която долните и средните слоеве на обществото (гражданите и благородството) се противопоставят на висшите класи. Путивл се противопостави на Москва.
Много окръзи на Русия имат свои собствени държавни органи. Държавната система за управление започна да се разпада. Към разбунтувалите се руснаци се присъединиха марийци, мордовци, чуваши, татари, които не приеха натиск от православното духовенство, завземането на техните прадеди от руски патримониали, земевладелци и манастири.
Въстанически поход към Москва. Иван Болотников.
До есента на 1606 г. край град Йелец се формира бунтовническа армия. Оглавяваха го благородниците Истома Пашков, Прокопий Ляпунов и Григорий Сунбулов.
В Путивл се формира друга армия. Опитен воин Иван Болотников застана начело на тази армия. След като е бил военен слуга на княз Телятевски, след това избягал на юг при казаците, воювал с кримските татари, бил в плен, откъдето бил продаден на Турция. Известно време Болотников беше принудителен гребец на галери. По време на морска битка италианците го освободиха и той се озова в Европа. Той живее във Венеция, прибира се през Германия и Полша. В Полша той научи за събитията в Русия и застана на страната на „истинския цар Дмитрий“, въпреки че по това време самозванецът вече беше мъртъв. Молчанов, представяйки се за избягалия цар, му даде писмо до Путивл, а княз Шаховской назначи Болотников за командир на въстаническия отряд. Болотников се нарича губернатор на цар Дмитрий Иванович.