Терминатор (Генетика) - Биология

Кога Терминатор или Терминатор за транскрипция е част от генетична последователност на ДНК, която маркира края на ген или оперон. Това води до прекратяване на транскрипцията.

В прокариотите са известни два класа транскрипционни терминатори:

  • Вътрешни терминатори на транскрипция
  • Rho-зависими транскрипционни терминатори

Терминаторът обикновено се състои от кратка последователност (4-10) от GC базови двойки и се намира в РНК почти веднага след стоп кодона, който описва края на ORF. Протеините, които блокират прекратяването на транскрипцията, се наричат ​​антитерминатори.

Rho-независимо прекратяване

При този тип терминация, в РНК транскрипта се развива вторична структура с форма на фиби. Причината се крие в специалната последователност от бази.

Оптималната структура за присъщ терминатор [1] води до следното:

терминатор

  • Формиращ щам GC богат регион 1 (6-8 базови двойки)
  • Област, образуваща примка (3-5 базови двойки)
  • Щамообразуващ GC богат регион 2 (6-8 базови двойки)
  • Поли урацилов регион (3-8 базови двойки)

Двата богати на GC региона се обединяват, за да образуват така наречения багажник. Областта между тях образува така наречения цикъл или цикъл. Тази структура на фиби води до дълга пауза при удължаване. Това корелира пряко пропорционално на стабилността на структурата на фиби. Следващите 3-8 остатъци от урацил дестабилизират удължения комплекс [2]. Популярната теория е, че структурата на фиби съкращава РНК/ДНК хибрида и нестабилното AU сдвояване допълнително дестабилизира комплекса. Последицата от това е отхвърлянето на стенограмата [3] .

Значение на структурата на фиби за прекратяване

Структурата на фиби допринася за прекратяване по два начина [4] [5]

  • РНК структурата на фиби води до алостерично инхибиране на добавянето на нуклеотиди в активното място. Това ще спре RNAP.
  • Структурата на фиби осигурява отделяне на РНК - ДНК хибрид в 5’– края.

Rho-зависимо прекратяване

За разлика от присъщите терминатори, rho-зависимият терминат не съдържа никакви дестабилизиращи елементи на ДНК последователност. Тук терминирането се катализира от фактора на терминиране Rho. Комплексът на удължаване се дестабилизира от хеликазната активност на Rho фактора [6]. Rho разпознава тук богатите на C раздели в стенограмата като хексамер. Той се свързва с област от около 100 bp нагоре от удължителния комплекс върху новосинтезирания РНК транскрипт. Rho се придвижва към 3 'края на РНК поради своята АТФазна активност. Тази хеликазна активност на терминационния фактор води до отделяне на РНК/ДНК хибрид. Последицата е дисоциация на удължения комплекс и произтичащото освобождаване на РНК транскрипта [7] .

Разграничение

Терминаторните последователности на ДНК трябва да бъдат разграничени от терминаторните кодони на иРНК, които водят до прекратяване на транслацията.