Стомашно-чревни нарушения при новородени със синдром на Даун
Вродени стомашно-чревни лезии се срещат при 1-5% от новородените със синдром на Даун, в зависимост от естеството на оплакването. Най-често срещаните са:

Ако новороденото няма изпражнения през първите няколко дни, то може да има рентгеново изследване, но е необходима биопсия на червата, за да се диагностицира ясно болестта на Hirschsprung. Това означава, че парче ректална тъкан се отстранява и изследва. Лечението обикновено включва хирургично отстраняване на неправилно функциониращо черво.
Ако бебе със синдром на Даун повръща много от раждането си, то може да принадлежи на 5%, които обструкция на тънките червамикробуса. Това се случва, когато тънките черва не се развиват по обичайния начин във феталната възраст или когато панкреасът се извива и затваря за тънките черва. Последицата и в двата случая е, че храната не може да премине през тънките черва. Обструкцията на тънките черва може да бъде лекувана хирургично.