Сперматозоидите на затлъстяването - Хроники на геномиката

Бертран Йордания 1, 2 *

1 UMR 7268 ADÉS, Екс-Марсилия, Университет/EFS/CNRS, Средиземноморско етично пространство, Болница за възрастни La Timone, 264, улица Saint-Pierre, 13385 Марсилия Cedex 05, Франция
2 CoReBio PACA, кутия 901, научен парк Luminy, 13288 Марсилия Cedex 09, Франция

Демонстрация на (донякъде) специфично диференциално съдържание на РНК и метилиране на ДНК в сперматозоидите от затлъстели индивиди отваря възможността за епигенетично предаване на потомство.

Google Scholar

(→) Вижте тематичния брой DOHaD, г-ца n ° 1, януари 2016 г.

(→) Вижте също тематичния брой DOHaD, г-ца n ° 1, януари 2016 г.

Кльощавото и дебелото: доста фини разлики

Авторите са анализирали сперматозоидите на 13 души с нормално наднормено тегло (среден ИТМ 22,9) 1 и на 10 затлъстели (среден ИТМ 31,8), от гледна точка на позиционирането на хистона (чрез разграждане на Микрокок 2), малко некодиращо съдържание на РНК (малки некодиращи РНК, sncRNAs) и метилиране (чрез секвениране след третиране с бисулфит). Не се наблюдава разлика между двете групи за позиционирането на хистоните. На ниво sncRNA най-представените видове са трансферни РНК фрагменти, както и РНК, взаимодействащи с Piwi протеини (piRNAs), които участват в регулирането на генната експресия [8]. Значителни разлики в експресията се наблюдават за около 40 piRNAs, някои от които могат да регулират гените, участващи в апетита. Установените разлики обаче са скромни, с частично или понякога пълно припокриване на стойностите, наблюдавани в двете групи. (Фигура 1).

Диференциална експресия на piRNA в "слаби" и "мазнини". На оста y, нивото на експресия се нормализира спрямо общите пиРНК в пробата; синьо: тънки обекти, червено: дебели субекти. Това може би са най-острите разлики, но можем да видим, че те до голяма степен се припокриват. Черните точки отговарят на стойностите, които авторите считат за извънредни (извадка от Фигура 2 от Донкин и др. [6]).

Данните за метилиране показват, че много гени, над 9 000, са диференцирано метилирани, като понякога има значителни разлики между сперматозоидите от двете групи. Анализ на природата на тези гени (анотация от Онтология на гените) показва скромно обогатяване за тези, които участват в развитието и функцията на централната нервна система (Фигура 2). Авторите правят връзка с работата, показваща повишен риск от аутизъм при деца със затлъстели бащи [9] - предвид скромността на наблюдаваното обогатяване (Фигура 2), човек обаче може да остане доста скептичен. И накрая, анализ на варианти на ДНК, за които е известно, че участват в затлъстяването, изключва, че те са отговорни за наблюдаваните разлики (с други думи, че това е генетичен феномен, а не епигенетичен).

Гени, анотирани във функционално отношение (Генна онтология) в бази данни. В розово: диференциално метилирани гени; в синьо: набор от анотирани гени. Вижда се, че гените, принадлежащи към представените категории, са малко по-чести сред диференциално метилираните гени (извлечение от фигура 3 на Донкин и др. [6]).