SARS-CoV-2 ИЗПИТВАНЕ НА КОРОНАВИРУС Medlife
Автор: Д-р Василеску Роксана, главен медицински директор на лабораторията MedLife Grivita, Букурещ
SARS-CoV-2 (Тежък остър респираторен синдром Coronavirus 2) принадлежи към семейство Coronaviridae, групата на бета-коронавирусите.
коронавируси са вируси с обвивка, от едноверижен тип РНК с големи размери, около 125 nm. Вирусният геном кодира 16 неструктурни протеина и 4 структурни протеина.
Последните са: протеин S (скок), протеин E (обвивка), протеин M (мембрана) и протеин N (нуклеокапсид).
Редица коронавируси (HCoV-229E, HCoV-NL63, HCoV-HKU1, HCoV-OC43) причиняват ендемични леки респираторни състояния, включени в групата на често срещаните „настинки“ или „често срещани респираторни вируси“. Два други коронавируса причиниха тежки дихателни огнища. Това е за:
• SARS-CoV, идентифициран през 2002 г. в Южен Китай, в бързоразпространяващия се глобален регион Гунагдонг и който към момента на своето изчезване през 2004 г. е причинил над 8 000 случая на хора и 774 смъртни случая (9,5% смъртност) и
• MERS-CoV (Близоизточен респираторен синдром на коронавирус), идентифициран през 2012 г. в Саудитска Арабия, широко разпространен в 27 страни и все още циркулиращ в Близкия изток, който досега е установил 2521 случая и 919 смъртни случая (смъртност 35 %), свързващи стомашно-чревни симптоми и остра бъбречна недостатъчност.
Изглежда, че естественият резервоар на тези вируси е популациите на прилепите. При хората те се предават чрез междинен гостоприемник. Ако в случая на SARS-CoV и MERS-CoV този междинен гостоприемник е известен (цивета, съответно камила), за SARS-CoV-2 все още не е възможно да се посочи точно.
ТОРС-Cov-2 в света и в Румъния
В края на 2019 г. нов коронавирус беше идентифициран като причина за огнище на пневмония в Ухан - град в провинция Хубей, Китай. Той се разпространява бързо, което води до епидемия в цял Китай. На 11 март СЗО обявява пандемия на коронавирус. Първият случай, потвърден в Румъния, е на 26 февруари при мъж от окръг Горж. На 16 март беше обявено извънредно положение в Румъния, а на 22 март бяха съобщени първите смъртни случаи на COVID-19 в Румъния. Към днешна дата смъртността в Румъния при хора, заразени с SARS-CoV-2, остава около 5,6% в сравнение с нивото на тестване в страната.
SARS-CoV-2 причинява респираторна инфекция, наречена COVID-19 (коронавирусна инфекциозна болест - 2019), със среден инкубационен период от около 5 дни (граници 2-14 дни). Болестта се характеризира с предимно дихателни симптоми (треска, кашлица, затруднено дишане) с умерена интензивност в около 80% от случаите, но може да има тежки прояви (двустранна интерстициална пневмония), с прогресия до дихателна недостатъчност, остър респираторен дистрес (ARDS) водещата причина за смъртта. Има и случаи със стомашно-чревни прояви (особено диария), а при някои пациенти (особено млади) като ранни симптоми се съобщава за хипо/аносмия (загуба на миризма) и хипо/дисгевзия (загуба на вкус).
Как да тествате?
Референтният тест за специфичната диагноза на COVID-19 е по NAAT технология (технология за амплификация на нуклеинова киселина), съответно обратна транскрипция в реално време PCR (qRT-PCR).
Този тест разкрива наличието на вирусна РНК в назофаринкса; с други думи, това свидетелства за наличието на вируса.
Серологичните тестове се извършват върху кръв и показват наличието на антивирусни антитела (SARS-CoV-2), антитела, които представляват имунния отговор на гостоприемника спрямо наличието на вируса. Тези антитела са имуноглобулини, принадлежащи към класове A, M, G, рядко D.
Предишни модели на серологични отговори от типа антитела към вирусни инфекции, най-общо казано, следната последователност от тези антитела с течение на времето от момента на вирусна инфекция:
• най-ранните са IgA,
• следете отблизо IgM,
• IgG антителата се появяват последни и остават във високи титри за по-дълъг период от време от предишните (IgA и IgM).
За някои вируси има период, в който антигенът (самият вирус) съжителства (може да бъде идентифициран) с антитела, особено ранните IgA и IgM антитела. Други вируси имат период на "серологичен прозорец", т.е. интервал от време между изчезването на антигена (в кръвта) и появата на антитела, така че интервал от време, в който инфекцията не може да бъде открита (минала).
IgG антителата са късни антитела, които обикновено се появяват след изчезването на антигена. IgG антителата, съхранявани в кръвта за дълги периоди от време, се считат за повечето вируси като защитни антитела; ако има нов инфекциозен контакт със същия вирус, или вирусът се неутрализира незабавно и не започва да се локализира и размножава на клетъчно ниво, или цикълът на размножаване може да започне в клетката гостоприемник, но неговите ефекти (така че симптомите на заболяването ) са много по-ниски, отколкото при първичната инфекция.
Какво казват изследователите за серологията?
В момента специфичният имунен отговор на организма към SARS-CoV-2 е обект на множество проучвания във всички страни. Към днешна дата няма пълна валидирана информация както за динамиката на антителата към момента на заразяване, така и за тяхната устойчивост след елиминиране и неутрализиране на капацитета, така че способността им да предпазват от вирусна инфекция с SARS-CoV- 2. Повечето публикувани проучвания имат за референтен термин за динамиката на антителата началото на симптомите, а не времето на заразяване. На европейско равнище все още се провеждат проучвания върху населението, за да се установи серопреобладаване, полезно за мерки за контрол на инфекциите от гледна точка на общественото здраве и разбиране на значението на асимптоматичните инфекции.
При все още непълна информация за имунитета след инфекция с SARS-CoV-2, серологичните тестове могат да бъдат полезни при идентифициране на лица, които са развили имунен отговор, като част от активна инфекция или в резултат на предишна инфекция. Резултатите от серологичните тестове са особено важни при диагностицирането на асимптоматични или асимптоматични инфекции. Въпреки че все още няма пълна информация за имунитета след тази инфекция, серологичните данни могат да идентифицират субекти, които вече не са податливи на инфекция. Може да бъде полезно и за идентифициране на потенциални донори на плазма, които могат да се използват при лечението на тежки форми.
В допълнение, серологичните тестове могат да помогнат за диагностициране на активна инфекция, когато RT-PCR е отрицателна при пациент, представен в късната фаза на COVID инфекция)
Серологията, комбинирана с RT-PCR, също увеличава степента на откриване на SARS-VOC-2 инфекция до 98,6%.
Серологичните тестове обаче имат редица ограничения. Отрицателните серологични резултати не могат да изключат SARS-COV2 инфекция, особено когато инфекцията е скорошна. От друга страна, съществува риск от положителни резултати поради кръстосана реактивност с антитела, образувани в резултат на инфекции с други коронавируси. Серологичният метод се счита за валидиран, ако дава резултати, които правилно идентифицират наличието или отсъствието на антитела, при предварително дефинирано статистическо ниво на достоверност.
Въпреки че редица имунологични тестове се предлагат в търговската мрежа, тяхната точност за диагностика и оптимална употреба трябва да останат запазени в очакване на теста на времето.
IgG антитела към MedLife
Тестовете за IgG и IgM антитела върху аналитичната система Abbott са качествени серологични тестове, базирани на хемилуминесценция на микрочастици (CMIA). Откриват се вирусни нуклеокапсидни антитела срещу SARS-CoV-2. N протеинът във вирусния нуклеокапсид е най-разпространеният, имуногенен и добре запазен вирусен компонент, считан за добър диагностичен маркер.
За IgG антитела критериите за ефективност на теста са както следва:
Положителна прогноза (122 проби от 31 субекта, потвърдени положителни чрез PCR):
• • 3 - 7 дни от началото на симптомите: 25,00%
• 8 - 13 дни от появата на симптомите: 86,36%
•> = 14 дни от началото на симптомите: 100,00%
Отрицателна прогноза (997 серума преди септември 2019 г. + 73 проби от пациенти с респираторни симптоми, тествани отрицателно за PCR за nCOV)
• Проби от пациенти с отрицателен nCOV: 100,00%
Проучвания за кръстосана реактивност: 182 проби от потвърдени пациенти с 36 различни инфекциозни заболявания
• 181 проби са отрицателни за nCOV
• 1 на 5 проби от пациенти с CMV IgG е положителен