Протеомиката намира правилните терапевтични цели

Обобщение на файла

След геномиката ето систематичното изследване на протеините. Позволява откриването на маркери на болести и терапевтични цели.

През 1995 г., когато австралийският пост-докторант Марк Уилкинс говори за първи път за протеома (като набора от протеини в клетка), той нямаше представа, че въвежда изцяло нова наука.
Днес обаче протеомиката се счита за най-обещаващия биотехнологичен проект. И това, във време, когато дешифрирането на човешкия геном е почти завършено.

„Протеомиката представлява изследване на крайния продукт на експресията на ген, а именно на протеина“, обяснява Жером Гарин, директор на лабораторията за химическа протеинова хирургия CEA в Гренобъл.

Маркери на заболяванията
Тази дисциплина се състои в количествено определяне и идентифициране на всички протеини на клетката в дадена среда. Сравнявайки протеините на здрави и болни проби, можем да установим кои са специфични за дадена патология. След това тези протеини се превръщат в маркери на въпросното заболяване, в основата на новите диагнози. Но те също са потенциални цели за бъдещи лекарства срещу тази патология.

Една от първите биотехнологични компании, разработила концепцията за протеомика, е базираната в Обединеното кралство Oxford GlycoSciences (вж. I&T # 805). Първо в партньорство с Оксфордския университет: открити са около петдесет специфични ракови протеини. След това с най-големите фармацевтични групи.
В програмата от 1998 г.: търсене на протеини, специфични за болестта на Алцхаймер и атеросклероза (с Pfizer), астма и други белодробни заболявания (с Bayer), диабет (с Merck) и ракови заболявания (с Incyte).

Имайте предвид, че OGS също разработва растителна протеомика. Неговото партньорство с Pioneer Hi-Bred (група Du Pont de Nemours) има за цел да идентифицира протеини, свързани с растежа на културите, по-специално царевица.

Идентифицирайте стотици протеини на ден
Протеомиката се основава главно на две аналитични техники: двумерна електрофореза и масспектрометрия. 2D гел електрофорезата разделя протеините от смес в разтвор въз основа на техния електрически заряд и молекулна маса. И накрая, всяко петно, визуализирано върху гела (чрез радиоактивно оцветяване или етикетиране, флуоресцентно.) Съдържа различен протеин. „По този начин повече от хиляда протеини могат да бъдат анализирани с 2D гел за електрофореза“, уточнява Жером Гарин от CEA в Гренобъл.

След като се разделят, протеините се идентифицират чрез масспектрометрия. Тази техника сериозно ускорява задачата на изследователите. Преди това те идентифицираха един или два протеина на ден, чрез химично секвениране (методът на Edman). Благодарение на масспектрометъра от типа Maldi TOF (Matrix assisted laser desorption-Time of flight) те могат да характеризират няколкостотин на ден.

Основните производители на този тип устройства са Perkin Elmer Biosystems (които създадоха изследователски център за протеомика миналия март), Amersham Pharmacia Biotech, Bruker и Micromass.

Принципът: протеин, идентифициран в гела за електрофореза, се нарязва на пептиди под действието на ензим. Спектрометърът измерва масите на тези пептиди и дава "масова пептидна карта", която е достатъчно да се сравни с база данни за идентифициране на протеина. (Американската компания Proteome предлага в този контекст банки протеоми за хора, животни и микроорганизми).