Пространствени структури на протеини - Държавен образователен сървър Баден-Вюртемберг
Извиква се АА последователността на протеин Първична структура определен. С наличните днес методи той все още предоставя малко информация за пространственото подреждане (= пространствена структура) на протеините.
С помощта на съвременни методи за анализ (напр. Анализ на рентгеновата структура) могат да се получат по-точни познания за пространствената подредба.
Предполагат се още три нива:
Вторична структура
Третична структура
Кватернерна структура
Първо обратно към пептидната връзка:
Досега сме изтеглили пептидните връзки като гръбнак на пептидни или протеинови вериги като единични връзки. Всъщност това представяне представлява само мезомерна гранична структура на пептидната връзка, която поради разпределението на електроните между С = О връзката и NH връзката има характер на частична двойна връзка. Поради тази причина пептидната връзка е решаващ структурен елемент.
Мезомерни гранични структури на пептидната връзка:
Вторична структура:
Дългите полипептидни вериги могат да се подредят пространствено:
Водородните връзки между C = O и NH групите на пептидните вериги стабилизират тази пространствена подредба.
Прави се разлика между 2 форми: α-спирала и β-листна структура
α-спирала:
Полипептидна верига под формата на десен винт, открита в α-креатини, фибриларните протеини в косата
структура на β-листа:
Пептидна верига, сгъната на зигзаг, в зависимост от посоката на полипептидните вериги, се използва терминът „паралелни“ или „антипаралелни“ листове.
Третична структура:
е друго пространствено подреждане на протеините. Той описва формирането на стабилна пространствена структура на мономерни протеини, която се състои от комбинации от α-спирали и β-листове, както и вериги и други структурни елементи между тях.
Третичната структура се формира чрез взаимодействия между страничните вериги на аминокиселините:
- Водородни мостове
- хидрофобни взаимодействия
- Йонни връзки
- Дисулфидни мостове
Кватернерна структура:
Няколко идентични протеинови вериги със собствена първична, вторична или третична структура се обединяват, за да образуват функционална единица.
Много протеини в човешкия организъм са по-димерни (2 функционални единици) или тетрамерни, но броят им може да бъде и значително по-голям.