Нормална микрофлора на животинското тяло
Тялото на повече или по-малко голямо животно представлява цял свят с много екологични ниши за микроорганизми. В естествени условия тялото на всяко животно е обитавано от много микроорганизми. Сред тях може да има произволни форми, но за много видове тялото на животното е основното или единственото място на местообитанието им. Характерът и механизмите на взаимодействия на микроорганизмите с макроорганизма са разнообразни и играят решаваща роля в живота и еволюцията на много видове микроорганизми. За едно животно микроорганизмите са важен екологичен фактор, който определя много аспекти от неговите еволюционни промени.
От съвременни позиции нормалната микрофлора се разглежда като набор от микробиоценози, които заемат множество екологични ниши по кожата и лигавиците на всички телесни кухини, отворени за околната среда. В значителна част микрофлората е еднаква за всички животни в сравняваните биотопи, но има индивидуални разлики в състава на микробиоценозата. Автомикрофлората на здраво животно остава постоянна и се поддържа от хомеостазата. Тъканите и органите, които не комуникират с външната среда, са стерилни. Организмът и неговата нормална микрофлора съставляват една единствена екологична система: микрофлората служи като един вид „екстракорпорален орган“, който играе важна роля в живота на животното. Като биологичен защитен фактор нормалната микрофлора е бариерата, след пробива на която се индуцира активирането на неспецифични защитни механизми.
Кожна микрофлора
Кожата на тялото има свои зони, свой релеф, своя „география“. Клетките на епидермиса на кожата постоянно отмират и плочите на роговия слой се отлепват. Повърхността на кожата постоянно се "опложда" от продуктите на секрецията на мастните и потните жлези. Потните жлези осигуряват на микроорганизмите соли и органични съединения, включително такива, съдържащи азот. Мастните секрети са богати на мазнини.
Микроорганизмите колонизират предимно участъци от кожата, покрити с косми и овлажнени от пот. В областите на кожата, покрити с косми, има около 1,5-10 6 клетки/cm. Някои видове са ограничени до строго определени зони.
Обикновено грам-положителните бактерии преобладават върху кожата. Типични обитатели на кожата са различни видове Staphylococcus, Micrococcus, Propionibacterium, Corynebacierium, Brevibacicrium, Acinetobacter.
За нормалната кожна микрофлора са характерни такива видове Staphylococcus като Si. epidermidis, но не споменат от St. aureus, развитието на което тук показва неблагоприятни промени в микрофлората на организма. Представителите на рода Corynebacterium понякога представляват до 70% от общата микрофлора на кожата. Някои видове са липофилни, тоест образуват липази, които унищожават секрета на мастните жлези.
Повечето микроорганизми, които обитават кожата, не представляват никаква опасност за гостоприемника, но някои, и особено Св. ауреус са опортюнистични.
Нарушаването на нормалната общност на кожни бактерии може да има неблагоприятни ефекти върху гостоприемника.
Върху кожата микроорганизмите са податливи на действието на бактерицидни фактори на мастната секреция, които повишават киселинността (съответно стойността на рН намалява). Staphylococcus epidermidis, микрококи, сарцини, аеробни и анаеробни дифтероиди живеят в такива условия. Други видове - Staphylococcus aureus, β-хемолитични и нехемолитични стрептококи - по-правилно се считат за преходни. Основните зони на колонизация са епидермисът (особено роговият слой), кожните жлези (мастните и потните) и горните отдели на космените фоликули. Микрофлората на линията на косата е идентична с микрофлората на кожата.
Микрофлора на стомашно-чревния тракт
Дихателна микрофлора
Горните дихателни пътища носят голямо микробно натоварване - те са анатомично адаптирани към отлагането на бактерии от издишания въздух. В допълнение към обичайните нехемолитични и зелени стрептококи, в носоглътката могат да се открият непатогенни нейсерии, стафилококи и ентеробактерии, менингококи, пиогенни стрептококи и пневмококи. Горните дихателни пътища при новородени обикновено са стерилни и се колонизират в рамките на 2-3 дни.
Последните проучвания показват, че сапрофитната микрофлора най-често се изолира от дихателните пътища на клинично здрави животни: S. saprophiticus, бактерии от родовете Micrococcus, Bacillus, коринеформни бактерии, нехемолитични стрептококи, грам-отрицателни коки.
В допълнение са идентифицирани патогенни и опортюнистични микроорганизми: алфа и бета - хемолитични стрептококи, стафилококи (S. aureus, S. hycus), ентеробактерии (Escherichia, Salmonella, Proteus и др.), Pasteurella, Ps. aeruginosa, а в единични случаи и гъбички от рода Candida.