Microbiota и IBD; FMC-HGE
образователни цели
- Познайте компонентите на микробиотата
- Познайте понятията евбиоза и дисбиоза
- Познайте участието на микробиотата в генезиса на IBD
- Познайте условията за модифициране на микробиотата за терапевтични цели
Тествай се
Ключови думи: чревна микробиота, хронично възпалително заболяване на червата
Интересни връзки
Покана/лектор за PhM:
Abbvie, Astellas, Biocodex, Danone, Hospira-Pfizer, Janssen, MSD, Ferring Pharmaceuticals, Takeda. JD Покана/лектор: Biocodex, Danone, PiLeJe, Janssen, Enterome, MaaT Pharma, Indigo Therapeutics
Покана/лектор за PhS:
такси от Takeda, Merck MSD, Biocodex, Ferring, Takeda и Abbvie
Познайте компонентите на микробиотата
Терминът микробиота се използва за обозначаване на всички микроорганизми, присъстващи в дадена екосистема (бактерии, археи, дрожди, гъбички, вируси, бактериофаги). Различава се между нишите в храносмилателния тракт поради наложените върху него екологични условия (натиск за подбор) (рН, концентрации на кислород, жлъчни киселини, хранителни вещества и др.) [1]. Съществуват разлики и на същото ниво на храносмилателния тракт между чревния лумен, повърхностната слуз и дълбоката слуз, която концентрира антибактериални секрети от червата като IgA или дефензини [1]. Тук основно описваме фекалната микробиота, най-известната и която, въпреки че е по-отдалечена от човешките клетки, отколкото тази на слузта, има доказани връзки с физиологията, здравето и болестите.
Таблица I. Важни микроорганизми в чревната микробиота и тяхното място във филогенията *
(съществуват молекулярни маркери, които да разпознават в изпражненията или лигавицата мембрана видове бактерии, но също така и родове или фили)
Микробните асоциации на бактерии, археи, гъби (микобиом) ... не са резултат от случайност, а напротив, съпътстващите събития и конкуренцията се уреждат от екологични закони (конкуренция, симбиози, трофични вериги ...). Както при много други черти, хората са много сходни, но уникални по отношение на тяхната микробиота. Ако изберем правилните инструменти, всеки индивид може да бъде разпознат по своята микробиота. Въпреки това, ние разпознаваме малък брой микроорганизми, общи за повечето здрави хора, които съставляват микробно "ядро" и микробиотични механизми, които си приличат, които са били наречени "ентеротипове" и все още се обсъждат. [1, 2]. Молекулярните инструменти за изучаване на микробиотата (много молекулярни сонди) идентифицират някои видове, други микробни родове, други видове и дори има специфични за щама сонди. Подходите за масово секвениране осигуряват профили на тези различни нива на таксономия. Те предлагат много възможности за изследователите да изследват екосистемата, но, вярно, усложняват малко разбирането на работата на клиницистите (вж. Таблица I).
Към днешна дата тези знания не се използват в ежедневната клинична практика, а утвърдените инструменти за екологично описание са достъпни само за изследователи. Предлаганите на пазара оферти за качествени или количествени измервания на микробиота („микробни профили“) за момента не могат да се интерпретират по достатъчно надежден начин и не се основават на валидирани стандарти и референции, гарантиращи тяхната възпроизводимост и съпоставимост.
По същия начин резултатите от измерванията на фекалните метаболити на микробиотата (например с късоверижни мастни киселини) са (наред с други) толкова повлияни от условията на вземане на проби и екстракция, че интерпретациите на търговските комплекти най-често са много артефакти (ние не използвайте някой от предлаганите комплекти).
Познайте понятията евбиоза и дисбиоза
Обикновено гостоприемникът живее в добра хармония със своята микробиота, чиито функции (носени от състава) са благоприятни за него (еубиоза). По време на заболявания могат да се наблюдават аномалии в състава на микробиотата (терминът дисбиоза първоначално е бил посветен на тях), оправдаващи изследвания, за да се установи дали те могат да имат диагностична или прогностична полезност (биоиндикатори) или дори патогенно значение [1]. Има три вида композиционни аномалии по време на дисбиоза: излишък от патобионти (потенциално вредни микроорганизми), липса на полезни микроорганизми и загуба на структурата на екосистемата (по-специално ограничаване на биологичното разнообразие и/или богатството на микроби). Самото присъствие на патоген не е достатъчно за дефиниране на дисбиоза и има например здрави носители на токсиносекретиращи Clostridium difficile или Salmonella.
Биоразнообразието и микробното богатство са екологични характеристики, които обикновено са благоприятни за поддържане на стабилността на дадена екосистема, тъй като спомагат за нейната устойчивост и устойчивост (връщане в предишното състояние) в случай на смущения. Напротив, по време на дисбиоза обикновено се наблюдават нестабилност, ниско биологично разнообразие и микробна бедност. След първоначалната дефиниция, базирана на състава и структурата, понастоящем се счита, че дисбиозата е разбивка на симбиозата микробиота-гостоприемник [1, 3].
Определени отклонения в състава на микробиотата, свързани със заболявания или ситуации, са толкова характерни, че можем да използваме термина сигнатури. Ние сме близо до разпознаването на такива подписи при IBD и първичен склерозиращ холангит [4, 5]. Що се отнася до всички кандидати за биоиндикатори, тези подписи трябва да бъдат валидирани върху независими популации от болни и здрави субекти и тяхната способност да дискриминират болестта трябва да бъде тествана спрямо патологични ситуации, които са от значение за клинициста. Очакваме например да видим дали подписите биха помогнали да се разграничи чистата болест на Crohn на дебелото черво от UC, без резултатите от проучването да бъдат трудно интерпретирани от присъствието в изследването на пациенти с болестта на Crohn на тънките черва.