Медицински основи на микробиологичната терапия, Фрайбург принцип на действие
Колонизирането на човешките лигавици с полезни бактерии има важна защитна функция за предпазване от патогени и алергенни вещества или химикали. При лечението на много нарушения на имунната система или храносмилането, колонизацията на червата с полезни бактерии е от централно значение, тъй като представлява система за контрол и регулиране на по-високо ниво в сравнение с всички други лигавични системи. Всички микроорганизми заедно образуват чревната флора в червата.

Чревната флора има жизненоважни задачи, за да поддържа тялото ни здраво. Червата е не само най-големият орган в човешкото тяло, но и най-големият имунен орган. Чревните бактерии регулират части от метаболизма, обучават имунната система, помагат за защита срещу вредни микроорганизми, произвеждат витамини, подхранват чревната лигавица, стимулират чревната подвижност (перисталтика), подпомагат храносмилането и предотвратяват колонизирането на патогени. Те също произвеждат стотици неврохимични вещества (напр. Серотонин), които са необходими за контролиране на невронните функции като обучение и памет и за създаване на настроения. Чревните бактерии играят важна роля за избягване на алергични свръхреакции. По-специално ентерококите и Е. coli имат имуномодулиращ ефект и спомагат за развитието на толерантност към нормално безвредни антигени.
Антибиотици и други лекарства (например несероидни противовъзпалителни вещества като ацетилсалицилова киселина, инхибитори на протонната помпа), но също така и заболявания на червата, непоносимост към храна, лоша диета, хроничен стрес и други стресове могат да нарушат свързаната с червата имунна система. Впоследствие в чревната лигавица могат да се заселят патогенни бактерии и гъбички. Това причинява нарушения на стомашно-чревния тракт (метеоризъм, храносмилателни проблеми) и имунната система, като податливост към инфекция или прекомерни имунни реакции в смисъл на алергии. Тялото реагира с намалено благосъстояние, намалена работоспособност и податливост към инфекция. Нарушената чревна флора вече не може да работи правилно и не може да изпълнява адекватно имунологичната си функция.
Тук идва микробиологичната терапия. Той не действа антибиотично, а пробиотично и възстановява нарушеното равновесие с помощта на избрани, здравословни бактерии. В резултат на това чревната флора и имунната система възвръщат пълния си потенциал. Често е необходима и промяна в диетата.
Микробиологичната терапия е от особено значение в превантивните грижи по време на бременност и кърмене, тъй като майката предава част от защитната си флора на детето. Ето защо, особено в случай на фамилна анамнеза за алергии и проблеми с отбраната, е препоръчително вагинално и чревно рехабилитация на майката, тъй като в противен случай нормалните, благоприятстващи здравето микроорганизми не могат да бъдат усвоени в достатъчна степен.
Поради тази причина децата след стерилно цезарово сечение са по-податливи на инфекции, дискомфорт в корема, метеоризъм и колики в корема и в резултат на това имат значителни нарушения на съня. Следователно новородените трябва да бъдат лекувани с пробиотици след цезарово сечение. Също така е важно майките с алергични реакции да бъдат лекувани с пробиотици преди планираното цезарово сечение поне през последните 6 седмици преди раждането, за да се намали рискът от алергии към детето. Същото се отнася, ако антибиотиците са били дадени по време на бременност или непосредствено след раждането.