Биологично активен
Протеини, които разграждат протеините
Да се върнем обаче към разговора за катеричките.
Структурата на гръбнака на протеинова молекула е съвсем проста. Страничните радикали са прикрепени към въглеродните атоми, които са свързани помежду си чрез пептидната връзка –CO - NH–.
Досега няма отговор на въпроса, зададен някъде по-горе за това как възникват протеиновите молекули. Нека изчакаме още малко, като се има предвид обратният процес на разграждане на протеините в организма. Той върви с помощта на протеини - протеолитични ензими, които разцепват пептидната връзка с образуването в краищата на веригите на мястото на разкъсване на карбоксилната група -COOH и аминогрупата -NH2; докато настъпва хидролиза на една водна молекула.
Подобно на повечето други ензими, протеолитичните ензими имат специфичност, понякога доста висока и не разцепват всяка връзка. Тоест, има някакъв ензим за всеки отделен случай, но този конкретен ензим обикновено е специфичен само за малка част от връзките в протеиновата молекула.
Най-често тази специфичност се определя от вида на остатъка, участващ в образуването на атакуваната връзка и най-близките й съседи, но има и шампиони по специфичност, които са много по-фини. По този начин протеолитичният ензим ренин атакува само пептидната връзка след фрагмент от перфектно дефинирана аминокиселинна последователност от осем остатъка!
Помислете обаче за по-прост случай: храносмилателният ензим химотрипсин, който се секретира от панкреаса. Той разцепва пептидни връзки, в образуването на които участват неполярни, хидрофобни остатъци и го прави по-лесно, колкото по-голям е обемът на такъв остатък. Използвайки методите на рентгеновия структурен анализ, беше възможно да се установи пространствената структура на молекулата на химотрипсина. Поради това механизмът на нейното каталитично действие вече е известен във всички основни подробности.
Тук наричам този протеин, донякъде познат, просто химотрипсин; всъщност говорим за а-химотрипсин, тъй като има и други химотрипсини. Тъй като в бъдеще няма да имаме нужда от тях, ще продължим да пишем просто химотрипсин.