Време на поява на гъби
Гъбите се появиха на нашата планета преди около 1,3 милиарда години в протерозойската зона.
В строматолитите (коралоподобни седиментни образувания, карбонатни или силициеви) от този период са открити гъбоподобни организми, които приличат на гъби от дрожди и мукор. Като цяло палеонтологичните доказателства за гъбичното разнообразие са оскъдни. Гъбичните спори са по-устойчиви на влиянието на околната среда; следователно, спорово-поленовият анализ се използва широко в палеомикологията.
Във фанерозойския еон (палеозойската ера), в горния предкамбрий, са живели водни гъби. В кембрийските (преди около 600 милиона години) се появяват хитридни гъби, а вече в силурските (преди около 430 милиона години) се наблюдава преходът на гъбички от воден начин на живот към сухоземен. По това време лигавичните оомикот, аско и дейтеромикот живеят върху растителни останки в крайбрежните зони.
В девона (преди около 400 млн. Г.) в втвърдените тъкани на аксиалните органи на риния са открити ендофитни гъби от рода Глимити. Заедно със симбиотичните, те са изразили патогенни свойства. Ендомикоризата е била широко разпространена в ранния девон. Находките на първите древни лишеи (цианоличени) датират от това време. В девона се развиват и паразитни гъби и сапротрофи (аскомикот). Следователно торбестите гъби са по-древни в сравнение с базиди.