Търсене на List_MAPS

НАУЧНАТА ПРОГРАМА LIST_MAPS

Механизмите, позволяващи на Listeria monocytogenes да преминават и продължават да съществуват в голямо разнообразие от местообитания, все още са слабо разбрани. Ясно е обаче, че способността да се интегрират екологичните сигнали и да се развие подходяща реакция към условията на околната среда допринася за риска за здравето, свързан с присъствието на тази бактерия в хранителната среда.

задача Отговорен

Сърцевината на научния проект List_MAPS е да се интегрира реакцията на бактериите към условията на околната среда чрез системен биологичен подход и да се разбере как условията на околната среда могат да повлияят на способността му да генерира инфекция след поглъщане.

Четири експериментални устройства се използват за подробно изучаване на екологията на Listeria monocytogenes:

  1. Почва и ризосфера (зона около корените на растенията)
  2. Биофилми на агро-хранителната среда
  3. Хранителни и технологични стресове
  4. Мишката като модел домакин за изследване на заразността

Мрежата изучава по-специално:

  • Транскриптоми и протеоми в тези сложни среди
  • Механизми на физиологична адаптация чрез подходи на обратната генетика
  • Връзките между реакцията на стрес, клетъчната комуникация и RNome
  • Отговорът на биотичната среда
  • Връзката между състава на хранителните матрици и способността на патогена да инициира инфекциозен процес
  • Разработването на иновативен инструмент за оценка на вирулентността като заместител на животински модели за скрининг на колекции от щамове за свързване на биологичното разнообразие и заразността
  • Внедряването на търговско устройство за оценка на способността за формиране на биофилми при технологични условия
  • Светлината като дезинфекционен инструмент за хранителната промишленост

ОРГАНИЗАЦИЯ НА ИЗСЛЕДОВАТЕЛСКА ДЕЙНОСТ

Изследователските дейности на List_MAPS са организирани в 4 комплекта от задачи, съчетаващи глобални подходи (транскриптом и протеом), класически подходи за молекулярна биология и физиологични характеристики в четирите контролирани среди:

WP1: Събиране и интегриране на данни в специфичните среди

Цели: Екстракция на РНК и протеини в различните среди (задача 1); изграждане на база данни, включваща идентификация на TSS, RNA-seq и MACE анализи (задача 2); и интегрирането на данни от транскриптомиката и протеомиката (задача 3).

Отговорен партньор: GenXPro

WP2: Свързване на екологични сигнали и изразяване на вирулентност

Цели: Оценете ефекта на съставките на хранителната матрица и наличието на хитин върху нивото на вирулентност (задача 1), използване на данните от транскриптома за анализ на експресията на вирулона според условията на околната среда (задача 2), вирулентност оценка на колекция от мутанти (задача 3).

Отговорен партньор: Университетски колеж Корк

WP3: Инструменти за оценка на вътрешноспецифичното фенотипно разнообразие

Цели: Разработване и валидиране на иновативен тест за оценка на вирулентността в силико като заместител на животински модели (задача 1), разработване на комплект за оценка на образуването на биофилми (задача 2), анализ на разнообразието на колекция от щамове с тези инструменти (задача 3).