Тестът COVAM може да помогне за избора на единици реконвалесцентна плазма за лечение на
Разбирането на модела на имунните отговори при COVID-19 е от съществено значение за разработването на ефективна ваксина или антивирусни лекарства, насочени към оптималните антигени на тежкия остър респираторен синдром коронавирус 2 (SARS-CoV-2). Такива интервенции могат да помогнат за овладяване на пандемията, като предотвратяват разпространението на вируса или реинфекцията или поне намаляват тежестта на заболяването след инфекцията. Неотдавнашно проучване, публикувано на сървъра за препринти bioRxiv *, се стреми да установи модела на реактивност на антителата в реконвалесцентна плазма COVID-19 (CCP), който се използва широко като терапия за критично болни пациенти с COVID-19.
Реконвалесцентна плазма
Реконвалесцентната плазма е лечебен подход с дълга история. Той е използван при предишни огнища на грип, ТОРС и други смъртоносни вирусни огнища, за да предизвика пасивен имунитет при реципиенти по време на активната фаза на инфекцията. Ефективността му поне отчасти се дължи на наличието на неутрализиращ Ab срещу причинителя на вируса, който предотвратява неговата репликация и по този начин облекчава тежестта на клиничното състояние.
Много изследователи провеждат клинични изпитвания с различен дизайн, за да характеризират истинската ефективност на CCP и да определят оптималния режим за неговото използване. Например видът на изотипите на антителата и тяхното ниво на експресия са основни параметри при определяне на въздействието на CCP върху COVID-19.
Настоящото проучване изследва използването на тестова технология, наречена Coronavirus Antigen Chip (COVAM), за да се получи профил на характеристиките на реактивността на антителата в PCC преди използването му при даден пациент.
Стандартният серологичен тест е двоичен
Понастоящем рутинното серологично изследване води до двоичен резултат и измерва титрите на изотипа на единично антитяло спрямо единичен антиген или епитоп, в зависимост от това дали титърът е над или под повече или по-малко произволен праг. По принцип тестът не отчита действителната реактивност на антитялото, независимо дали е над или под предварително зададения праг.
Границата се определя чрез използване на положителни и отрицателни контроли, установени и валидирани за специфичното антитяло или набор от антитела. Някои тестове използват смес от антигени, с вторични антитела, насочени към различни изотипове на първични антитела. Те генерират агрегирана стойност на антитела; следователно това се представя като двоичен, положителен или отрицателен резултат.
Какво е COVAM?
Платформата COVAM се отнася до евтин мултиплекс анализ, който позволява тестване на антитела в работен процес с висока производителност. Той използва набор от няколко пречистени антигена, валидирани от спектър от коронавирусни и некоронавирусни антигени, отпечатани върху слайдове с нитроцелулозно покритие за серологични тестове. Това включва 11 антигена от SARS-CoV-2, по 5 от SARS и MERS-CoV и 12 от сезонни коронавируси. Освен това 35 са от други остри респираторни вируси.
COVAM е част от хемометричен подход, който количествено определя нивата на интензивност на няколко специфични сигнала независимо, за да класифицира пробите, съдържащи антитела. Въпреки това, в настоящата ера на усъвършенствани геномни инструменти, се прилагат и усъвършенствани многовариантни аналитични инструменти, използващи машинно обучение, разпознаване на модели и клъстер анализ.
Това помага да се развие геномна сигнатура, включваща както геномната последователност, така и модела на генна експресия. Тези методи са полезни и при клинично диагностични тестове.
Тестът COVAM може да бъде проведен, за да се разбере какви антитела са в серумната проба, което от своя страна разкрива на кои вируси е бил изложен пациентът и следи динамичните промени в профила на антителата с течение на времето. Неговият дизайн може да позволи мащабни проучвания за разбиране на епидемиологията на COVID-19, разкривайки разпространението и титъра на различни антитела в популацията в различни точки на огнището.