Структура разделяне на макромолекули киселина амин уроци за електрофореза Преподаване и
1. Смес от следните аминокиселини се подлага на хартиена електрофореза при рН 3.9: A, S, F, L, R, D, H. Кои аминокиселини мигрират към анода? Кои аминокиселини мигрират към катода ?
2. Защо аминокиселините с един и същ заряд се отделят съвсем леко по време на електрофореза (пример: Gly срещу Leu) ?
3. Помислете за сместа от аминокиселини A, V, E, K, T при pH 6. Какъв е профилът на миграция след електрофореза на хартия? Посочете местоположението на отлагането, анода, катода и всички неразделени аминокиселини. Кой продукт помага за разкриване на аминокиселини ?
Принцип и използване на електрофорезата
Целта на електрофорезата е да отдели заредените молекули през гел (полимер) под въздействието на електрическо поле .
Молекулите се движат към полюса на заряда, противоположен на нетния им заряд z, със скорост v, пропорционална на този заряд: v = E. z/f
- E е силата на електрическото поле
- f е силата на триене
Следователно електрофоретичното разделяне се извършва според съотношението [заряд/маса] .
Електрофоретичната подвижност на молекулата може да бъде изразена (по опростен начин) чрез съотношението: подвижност = k. (pH - pI)/моларна маса
където pI е изоелектричната точка на молекулата.
Помислете за протеин с pI = 5:
- ако рН на буфера, използван за хроматографията, е по-ниско от pI на протеина (синя зона - фигура по-долу), последният се зарежда положително: трябва да се използва катионен обменник
- ако рН на буфера, използван за хроматография, е по-голямо от pI на протеина (червена зона), последният се зарежда отрицателно: трябва да се използва анионообменник.

Електрофорезата позволява, наред с други неща, да:
| Въпрос 1. В случай на смес от аминокиселини (A, S, F, L, R, D, H.), подложена на електрофореза върху хартия при pH 3,9: |
| Аминокиселина | pI | зареждане при pH 3,9 | посока на миграцията |
| AT | 6 | + | катод |
| С | 5.7 | + | катод |
| F | 5.5 | + | катод |
| L | 6 | + | катод |
| R | 10.8 | +++ | катод |
| д | 2.9 | - | анод |
| З. | 7.6 | ++ | катод |
| Забележка: в зависимост от източника стойностите на pI или pKa се различават леко. | |||