Общ анализ на изпражненията нормални с микроскопия
Микроскопско изследване на фекални вещества или копроцитограма обикновено се разглежда като част от общия анализ на изпражненията, но някои специалисти се открояват като отделен тест, който изисква допълнителна подготовка и поради това не винаги се извършва заедно с макроскопско описание на свойствата на изпражненията. Обикновено три предметни стъкла се правят от проба на изпражнения, изолирана за анализ. В случай на общ анализ на изпражненията, в много случаи търсенето на яйцата на червеи и хелминти не се извършва - често изпражненията за изследвания идват вече охладени, а анализът на изпражненията за яйца на червеи и протозои се извършва само в топли изпражнения.
Кога микроскопско изследване на изпражненията се прави по-фина дефиниция за работата на стомашно-чревния тракт, тъй като под микроскоп е възможно по-точно да се определи степента на храносмилане. Чрез наличието на определени хранителни компоненти във фекалиите е възможно да се определи кой етап от храносмилането страда и патологията на кой орган причинява това.
Капки неутрална мазнина и кристалите на мастни киселини във фекалиите се определят нормално в изключително малки количества, докато соли на мастни киселини (сапун) изобщо не се наблюдават. Рязкото увеличение на броя на микроскопичните капчици мазнини във фекалните маси, заедно с появата на иглени кристали на соли на мастни киселини, показват нарушение на храносмилането и усвояването на мазнините. Голямо количество мазнини във фекалиите също променя физическите си свойства - става мехлем, по-мека консистенция. Всичко това, заедно с характерната микроскопична картина, се нарича стеаторея. Причината за лошото усвояване на мазнините може да бъде липсата на жлъчка (в резултат на чернодробна и обструктивна жълтеница, холецистит), нарушена секреция на панкреатични ензими, главно липаза, която се появява при панкреатит. Голям брой кристали мастни киселини с умерено или незначително съдържание на мастни капки показва малабсорбция в тънките черва, което се случва със синдром на малабсорбция, ентерит, амилоидоза на тънките черва.
Растителни фибри или целулозата във фекалиите е нормален компонент, който служи като скеле от фекални вещества. Микроскопският анализ на изпражненията определя наличието или отсъствието на така наречената смилаема целулоза, която обикновено се разпада напълно в тънките черва и липсва във изпражненията. Неговото присъствие се проявява при бърза перисталтика (с възпалителни промени в червата) или при липса на симбиотична микрофлора (дисбиоза), която разгражда този вид фибри.
Нишесте обикновено отсъства в изпражненията, появата му в общия анализ на изпражненията често се наблюдава заедно с появата на смилаема фракция на фибри. Наличието на много нишестени зърна във фекалиите се нарича амилорея и показва инактивиране на ензима на панкреаса и слюнката - амилаза. Причината за това може да бъде високата киселинност на стомашния сок, която неутрализира работата на амилазата или недостатъчното освобождаване на ензима в резултат на увреждане на панкреаса.