Инсталиране на софтуер
Този раздел е в процес на попълване. Извиняваме се.
Съдържание
Всяка текуща дистрибуция на Linux е подходяща за изпълнение на задачите на семинара. Например разпространението на Ubuntu е много често: http://www.ubuntu.com, http://www.ubuntu.ru.
Ако не е възможно да инсталирате Linux на отделен компютър, тогава за да стартирате Linux среда, можете да използвате системата за виртуализация VirtualBox, която е достъпна за голям брой операционни системи, включително Windows и Mac OS X. Инструкции за инсталиране на Ubuntu Linux във виртуална машина: http://en.wikihow.com/install-Ubuntu-in-VirtualBox
Можете също да използвате готово изображение на виртуална машина.
Семинарът използва пакета за молекулярна динамика GROMACS. В повечето съвременни дистрибуции на Linux този пакет може да бъде инсталиран с помощта на стандартния инструмент за добавяне/премахване на програми. Препоръчително е да използвате този метод. Например в Ubuntu можете да използвате основния инсталатор на системата, графичната помощна програма synaptic, за да инсталирате Gromacs или да изпълните командата в командния ред:
sudo apt-get инсталирайте gromacs
Ако версията на Gromacs, доставена с вашата система, е твърде стара или твърде нова, можете да инсталирате желаната версия в домашната си директория. За това се използва сглобяване от изходни кодове. Системата трябва да има инсталирани компилаторите C и C ++ и системата за изграждане на CMake. В Ubuntu те могат да бъдат инсталирани с командата