Хидрофобност, полярност и заряди
Тук е предаден структурният принцип на разтворимите глобуларни протеини.
"Хидрофилна обвивка, хидрофобна сърцевина"
Представянията на звънците анализират взаимодействията на молекула глобин с околната среда. „Съобщението за дома“ в този раздел се основава на общия структурен принцип на разтворимите протеини: Вътре хидрофобен (стабилизиране на третичната структура чрез взаимодействия на Ван дер Ваалс), външен хидрофилен (свързване на водата на хидратация чрез водородни връзки).
- Първата илюстрация показва цветово кодираното разпределение на хидрофобните, полярните и заредените аминокиселини на повърхността на глобина, както и кислородните атоми на част от хидратиращата вода. При въртене на протеина, хидрофилните и хидрофобните повърхностни участъци се появяват ясно. Докато хидрофилните области образуват водородни връзки с разтворителя и поддържат протеина в разтвор, хидрофобните области стабилизират кватернерната структура на молекулата на хемоглобина чрез хидрофобни взаимодействия протеин-протеин между четирите глобина (естествена структура на протеинов комплекс, съставен от няколко протеинови субединици).
- Следващият раздел прави анатомията на глобина - представител на всички разтворими протеини - ясна. Докато ядрото се стабилизира от взаимодействията на хидрофобни странични групи, повърхността, изложена на средата, е осеяна с хидрофилни остатъци.
- Този структурен принцип е илюстриран с помощта на по-нататъшни секционни равнини, които първоначално проникват все по-дълбоко във (хидрофобната) вътрешност на протеина, за да се приближат отново до неговата (хидрофилна) повърхност (Фиг. 8).
Основна информация: структурно кодиране и самосгъване
Как се сгъват протеините?
Предсказване на протеиновите структури
"Асистирано самосглобяване"
Молекулярна патология на полимеризацията на сърповидно-клетъчен хемоглобин.