Аптамери за диагностика на рак
Ще намери и неутрализира
Наталия Булгакова, „Поиск“ No 21-2015
Аптамерите са синтетични едноверижни РНК или ДНК молекули, способни да се свързват с желаните цели. С други думи, едноверижната ДНК молекула образува триизмерна структура, наподобяваща пръстен с „опашки“ с различна дължина, простиращи се от нея. Именно с тях той се "свързва" с регионите на молекулата на този или онзи протеин. Последователността на олигонуклеотидите, образуващи ДНК молекулата, определя конформацията (геометрични форми, които молекулите могат да приемат) на аптамера, а оттам и неговия афинитет към целта (т.е. силата на свързване към молекулата на протеина, избран от изследователя) . Избирайки правилната последователност от голяма библиотека аптамери, учените получават нужните им, например тези, които се свързват с раковите клетки. Развъждането, честно казано, не е лесен въпрос: в края на краищата такава библиотека включва 10 до 12 степен на различни последователности (видове аптамери) и само няколко са подходящи за решаване на проблема. Аптамерите се наричат „цифрови лекарства“: от тях могат да се правят диагностични и терапевтични лекарства. Изследванията в тази област започнаха в чужбина в края на 90-те години и се считат за много обещаващи.
- Как избирате желаната последователност?
- Ако подберем аптамери за туморната тъкан, първо вземаме кръвни клетки от здрав човек и здрава тъкан. Не искаме аптамери да се свързват с тях. Ние инкубираме библиотеката на аптамерите с тези клетки. Ние не се нуждаем от тези аптамери, които са се свързали със здрави клетки и ги разделяме. Останалите аптамери се инкубират с ракови клетки. Премахваме несвързаните аптамери и оставяме тези, които го правят. Увеличаваме броя на техните разширени копия. При амплифициране на олигонуклеотиди се появяват произволни промени в последователността, които са необходими за осъществяването на насочена „еволюция in vitro“.
Правим няколко такива кръга, вървим 10-15 пъти в този кръг. И тогава проверяваме в кой кръг имаме аптамерите, които се свързват най-добре с желаните цели - раковите клетки - и не се свързват с останалите клетки. Получените аптамери могат да бъдат тествани по подобен начин за клетки от други видове тумори. Колкото по-строг е отрицателният подбор, толкова по-добри аптамери се получават.