Анализът на генома Covid-19 разкрива двойния произход на вируса Health Magazine
Covid-19: анализът на генома ще разкрие двоен произход на вируса
Вирусът SARS-CoV-2, отговорен за пандемията Covid-19, е обект на множество генетични анализи по целия свят, за да се разбере неговият произход и еволюция.
В рамките на няколко седмици всички научихме много неща, но също така чухме доста слухове за болестта Covid-19 и вирусът, отговорен за: SARS-CoV-2. Въпреки че броят на научните трудове за този вирус продължава да се увеличава, все още има много сиви зони по отношение на произхода на този вирус.
При какви животински видове се е появил? Прилеп, панголин или някаква друга дива природа? От къде е той ? От пещера или гора в китайската провинция Хубей или другаде ?
През декември 2019 г. 27 от първите 41 хоспитализирани (66%) преминаха през пазар, разположен в сърцето на град Ухан, провинция Хубей. Но произходът на епидемията вероятно не е свързан с контакт с живи или мъртви животни, присъстващи на този пазар, тъй като изглежда, според китайско проучване, проведено в болницата във Ухан, че първият установен случай на хора не е посетил този пазар.
В съгласие с тази хипотеза, молекулярното датиране, оценено от геномните последователности на SARS-CoV-2, по-скоро показва произход през ноември. Следователно имаме право да се чудим за връзката между тази епидемия Covid-19 и дивата природа.
Какво знаем от геномните данни за бетакоронавирусите
Геномът на SARS-CoV-2 беше бързо секвениран от китайски изследователи. Това е РНК молекула от около 30 000 основи, съдържаща 15 гена, включително S гена, който кодира протеин, разположен на повърхността на вирусната обвивка (за сравнение, нашият геном е под формата на двойна спирала на ДНК, приблизително 3 милиарда основи в размер и съдържа почти 30 000 гена).
Сравнителните геномни анализи показват, че SARS-CoV-2 принадлежи към групата Betacoronavirus и че е много близък до SARS-CoV, отговорен за епидемията от остра пневмония, която се появява през ноември 2002 г. в китайската провинция Гуангдонг, която след това се разпространява до 29 държави, особено във Франция през 2003 г.
Регистрирани са общо 8 098 случая, включително 774 смъртни случая. Известно е, че прилепите от рода Rhinolophus (потенциално няколко пещерни вида) са резервоарът за този вирус и че малко месоядно животно, палмовата цивета (Paguma larvata), би могло да служи като междинен гостоприемник между прилепите и прилепите. Първият човек дела.
Оттогава са открити много бетакоронавируси, главно при прилепите, но и при хората. По този начин вирусът RaTG13, изолиран от прилеп от вида Rhinolophus affinis, събран в китайската провинция Юнан, наскоро беше описан като много близък до SARS-CoV-2, като последователностите на техния геном са 96% идентични. Тези резултати показват, че прилепите, и по-специално видовете от рода Rhinolophus, представляват резервоара на вирусите SARS-CoV и SARS-CoV-2.